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不同种群獐的遗传多样性及保护对策研究 【摘要】：獐，别名河麂、牙獐，属于鹿科，偶蹄目，共记录2个亚种：HydropotesinermisinermisSwinhoe，1870，和HydropotesinermisargyropusHeude，1884。亚种Hydropotesinermisinermis曾广布于我国辽东半岛，华北平原及长江两岸，既北纬28°至42°之间，东经110°以东范围内，现在的分布范围处于北纬24°-34°及东经110°以东范围内；另一亚种Hydropotesinermisargyropus在朝鲜半岛有自然种群的分布，主要分布在北纬43°以南地区。20世纪初獐被引种到英国，有报道獐也被引入了法国。近年来我国野生獐的数量急剧下降，分布地区也急剧缩小，獐在许多分布区内已经绝迹或很罕见。獐已被列为我国国家二级保护动物，IUCN红皮书将其列为低危／接近受危(LR／nt)。因此，有必要对獐的分布与生境变迁、现存的主要种群遗传结构与致危因素进行分析，提出科学可行的保护策略。本研究用非伤害性和非损伤性的取样方法采集了我国浙江省、江苏省、江西省和韩国境内分布的獐肌肉、皮张、血液、毛发、粪便、骨骼等样本，实验测得獐细胞色素b、控制区、12SrRNA三个基因及基因间tRNA，序列总长2761-2764bp，以及一个林麝样本的细胞色素b全序列和12SrRNA487bp序列。另外，筛选了11个引物对舟山和盐城的样本进行了RAPD实验比较遗传多样性。同时，通过文献、考古考证调查獐的分布变化和原因，并考察獐在现主要分布地所面临的威胁，对獐的偷猎和重引入进行了问卷调查，结合保护遗传学的研究结果提出保护策略。研究结果与建议如下：1．实验得到线粒体DNA细胞色素b全序列36个样本，有21个单倍型；得到线粒体DNA控制区全序列27个样本，全长926-929bp，与Pro-tRNA基因相邻前端片段6个样本，采用与Pro-tRNA基因相邻的高变区400bp进行分析，共有27个单倍型；得到线粒体12SrRNA487bp序列34个样本，共有12个单倍型。獐的细胞色素b的平均差异为：1.40％，控制区高变区的平均差异为：2.13％，12SrRNA序列的平均差异为1.02％。獐的细胞色素b、控制区高变区和12SrRNA的核苷酸多样性分别为0.01339±0.02920，0.0174±0.0023和0.00804±0.0010，与其他珍稀鹿类动物相比，獐的遗传多样性程度较高。2．从线粒体DNA细胞色素b、控制区高变区和12SrRNA片断平均核苷酸差异(K)、核苷酸多样性(π)和双参数遗传距离的比较得出：盐城的遗传多样性最高，其次是吉山种群，舟山种群的遗传多样性最低。RAPD的实验结果也表明盐城【关键词】：獐(Hydropotesinermis)种群遗传多样性线粒体DNA细胞色素b控制区12SrRNARAPD保护对策重引入 【学位授予单位】：华东师范大学 【学位级别】：博士 【学位授予年份】：2006 【分类号】：Q943 【目录】：中文摘要5-8Abstract8-12目录12-15引言15-16第一章研究综述16-301獐的简述16-201.1獐的生物学特征161.2獐的分类16-181.3獐对于人类的价值18-191.4獐的濒危状况19-201.5獐的保护现状202保护遗传学简述20-232.1保护生物学与保护遗传学的产生20-212.2保护遗传学研究方法21-222.3线粒体DNA在保护遗传学研究中的应用22-233野生动物DNA研究取样方法简述23-284制定保护策略前需要了解的问题28-30第二章研究方法30-401保护遗传学的研究方法30-391.1样本来源与保存30-311.2DNA的提取31-331.3RAPD实验331.4线粒体DNA实验33-371.5数据分析方法37-392有关獐的调查方法39-40第三章獐的分布变迁及原因分析40-481古代獐的变迁40-441.1獐化石及残骸的考古发现40-421.2獐的古代生存环境变化42-442獐的分布现状及原因44-482.1獐在我国的分布现状44-452.2獐数量下降的原因分析45-472.3圈养獐的状况47-48第四章保护遗传学的研究结果及讨论48-871RAPD实验结果48-502线粒体DNA实验结果50-752.1线粒体DNA细胞色素b序列结果50-592.2线粒体DNA控制区序列结果59-682.3线粒体12SrRNA序列结果68-732.4线粒体DNA2761-2764bp序列系统树73-753实验结果的分析与讨论75-803.1遗传多样性程度75-773.2系统发育与分类77-783.3獐的亚种分类783.4我国种群间遗传关系78-793.5种群历史动态79-803.6进化显著