大熊猫(Ailuropoda+melanoleuca)肠道菌群结构分子生态学的探究.pdfVIP

中国畜牧兽医学会动物徽生态学分舍第三届第七次学术研讨会论文集(2004年) 大约含有400种以上的细菌类型。固有的肠道微生物在人类的健康中有很重要的作用。 它们可以帮助消化食物，代谢药物和有害外源复合物，产生一些必需的氨基酸和维生素 并有助于阻止病原体侵入胃肠道以及刺激免疫系统对致病菌产生免疫反应等等。 儿童阶段是一个人发展的重要阶段，但很多儿童没有良好的饮食习惯与饮食结构， FTT儿童是指那些生长发育指标(如身高体重等)低于该年龄平均水平的儿童。导致FTT 可能的原因之一是由于胃肠道菌群结构失调而引起的消化吸收功能不良。本研究以健康 儿童与FTT儿童为研究对象，用ERIC．PCR及微生物群落结构探针杂交的分子技术分析 比较肠道微生物种群的差异，以求找到肠道内某些与健康有重要关系的有益菌。 tO 本文通过ERIC．PCR对健康儿童与FTT(FailureThrive)儿童肠道中微生物区系的 指纹图谱异同进行研究。根据美国CDC对儿童生长发育的评价指标对某幼儿园200例4． 6岁儿童进行评价筛选出16例健康儿童和13例FTT儿童，每周1次连续3周跟踪取样． 提取粪便样品中细菌总DNA．获得其ERIC-PCR指纹图谱，群落结构探针杂交进一步在 序列水平上对图谱分析，结果显示同一个体肠道菌群结构在取样期间具有很高的稳定性； 健康儿童肠道菌群结构与FTT儿童的肠道菌群结构差异较大。肠道菌群结构与儿童发育 状况有一定的关系。 ERlC-PCR 关键词：F1下儿童 DNA指纹图谱 大熊猫0甜口，印口妇肌咖胛D胞|If∞)肠道菌群结构分子生态学研究 魏桂芳 鲁海峰 林志新 赵立平 (上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与基因组学实验室，上海200240) 大熊猫是中国本土的国家一级保护动物．现今世界上总共存活的数量不到1,500只。 大熊猫主要以竹子为食，然而其肠道结构却与食肉类动物的结构类似，简单的胃、盲肠已 经退化，结肠短而简单。那么，大熊猫是如何以食肉类动物的简单的胃肠道结构消化含有 大量纤维索的竹子食物是很值得研究的问题，对其肠道微生物多样性的研究非常必要。 目前，我们在很多方面对大熊猫的了解还不多，尤其是大熊猫肠道菌群结构的研究 上。国内．张志和(1995)和彭广能(1999)分别报道了用传统的培养的方法分析大熊 et 猫肠道微生物的组成情况；国外，Hirayama a1．(1989)报道了用培养的方法分离大熊 猫粪便样品中的微生物．然而，对大熊猫肠道微生物还没有通过分子生物学的方法进行详 细研究的报道。 本文通过PCR·TGGE的方法对比分析了3例大熊猫肠道微生物菌群结构，对其中的 1例个体通过16S rDNA建库测序分析。结果发现TGGE图谱中，3例大熊猫个体共享1 条优势主带；95个阳性克隆测序结果表明，均为已报道的肠道菌，其中有一类占有绝对 395 中国畜牧兽医学会魂物微生态擘分会第三届第七次学术研讨台论文集(2004年) 优势的细菌(76％)为梭状芽孢杆菌(Clostridiumdispoiicum)；序列以97％的同源性划 分为同一种时，可以分为8个OUT，以98％为界时，可以分为15个OUT，以99％为界 时可以分为36个OUT。 关键词：PCR-TGGE走熊猫肠道微生物茵群结构OTU 基于ERIC．PCR的分子杂交技术探寻人体肠道内共有 微生物的基因组特异的分子标记 魏桂芳赵立平 (上海交通走学生命科学技术学院微生物分子生态学与基因组学实验室，上海200240) tothrive)儿童肠道微生物菌 本文以食欲旺盛的健康儿童和食欲不振的FTT(failure 群为对象，用ERIC．PCR技术获得直接从粪便样品中提取的微生物混合基