基于PCR-DGGE技术分析生物絮团不同形成阶段细菌群落结构地研究.pdfVIP

2011年中国水产学会学术年会论文摘要集 基于PCR-DGGE技术分析生物絮团不同形成阶段细 菌群落结构的研究 夏耘，郁二蒙，余德光，谢骏：-=，王广军，李志斐 (1．中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室，广州 510380；2．上海海洋大学，上海201306) 摘要：为研究淡水池塘养殖系统内生物絮团的细菌群落结构，本文将草鱼放养于以池塘淡水 为水源的室内养殖系统中，添加碳源葡萄糖维持水体C：N为20：1以培养生物絮团；并采 用PCR—DGGE(变性梯度凝胶电泳)分析生物絮团形成第5天、10天和15天的细菌群落结 构。细菌群落结构分析发现，第10天时多样性最高，15天时多样性最低。相似性结果发现 5天和10天最高达67．4％，第5天和第15天相似性系数在三者中最低，仅为40．5％。测序 显示主要细菌为：CI．变形菌纲、y一变形菌纲、B一变形菌纲、放线菌纲、芽孢杆菌纲、拟杆 菌纲，其中Q一、13一及1，．变形菌亚纲的细菌占据主要位置，放线菌纲的细菌只在絮团培养的 10天或15天时存在。在生物絮团整个培养过程中Q．变形菌为3个阶段的共有优势菌。不 同形成阶段的特异菌多为产絮菌，5天时为食酸菌属、气单胞菌属、土壤杆菌属，10天和 15天时分别为芽孢杆菌属、红球菌属。综之，生物絮团应用于淡水池塘养殖系统时细菌的 组成和多样性都极其丰富，基于这些细菌的功能(变形菌可清除有机物、产絮菌净化水质； 拟杆菌、芽孢杆菌为益生菌)分析，生物絮团技术可作为一种有效的新型技术应用于淡水池 塘养殖系统。 关键词：PCR-DGGE；生物絮团：细菌群落；Q．变形菌属 ofmicrobial structureindifferent Analysis community ofBio--FlocsformationPCR--DGGEmethod stages by Xia Zhi·fei Yun，YuEr-meng，YuDe·guang，XieJun丰，WangGuang-jun，Li Resource (1．KeyLaboratoryofTropicalSubtropicalFishery ApplicationCultivation，MinistryofAgriculture， PearlRiverFisheriesResearch Ocean InstituteofCAFS，Guangzhou510380；2．ShanghaiUniversity,Shanghai 201306) bacterialcommunitiesofBio—Flocsin culture were Abstract：The pond systemsanalyzedbyusing thePCR-DGGEonthe5th．10th，and15th resultsindicatedthat of technology days．The diversity I onme15 bacteriaIintheBio．Flocswas ontheOth andminimum species highest day day．The 10th which ofbacterialcommunitieswas onthe5th and was67．4％． similarity