预测药物与蛋白质相互作用划分天然药物化学成份升压机制的研究.pdfVIP

预测药物和蛋白质相互作用划分天然药物化学成份升压机 制的研究 贺敏“，曹东升2，梁逸曾3，许青松4 1湘潭大学化工学院化学工程与制药系，湘潭411105，中国；2中南大学药学院，长沙 410013，中国；3中南大学化学化工学院中药现代化研究中心，长沙410083，中国： 4中南大学数学与统计学院，长沙410083，中国 摘要t一种通过化合物-蛋白质相互作用的方法被应用去评估升压机制。我们的方法假设不同升压机制的化 合物应该结合到不同的靶标蛋白，因此不同的机制可以通过化合物．蛋白质相互作用予以区分。首先，与血 压升高有关的天然药物成份和靶标蛋白被收集，使用一个随机森林模型计算化合物．蛋白相互作用概率，然 后根据参考文献和其它方法判断可信度。从一个热图、化合物．蛋白相互作用网络图，可以清晰地观察到天 然药物成份和不同的靶标蛋白的相互作用关系。最终，使用主成份分析对这些预测概率进行处理，这些升 压靶标能够划分为三个大的区域。本章探索了使用化合物．蛋白质相互作用进行药理(毒理)机制分类的可 行性，这个方案同时也适用于未知化合物的药理(毒理)机制推导。 Pressormechanismevaluationfor in silico phytochemicalcompoundsusing interaction compound—proteinprediction Min Xu4 Hel，Dongsheng Can。，YizengLiang3，Qingsong ofPharmaceutical ofChemical 1Department Engineering，School 411 105．P．R．China 。SchOO】ofPharmaceuticalSciences，CentreJSouth J0013．P．R．China University，Changsha,4 ’ResearchofModemization Center ofChineseMedicines，CentralSouth 410083，P．R．China University。Changsha 4 SchoolofMathematicalSciencesand South ComputingTechnology,CentralUniversity，Changsha410083，P．R． China Abstract：Inthis methodwas toevaluate mechanisms study,a applied pressor throughcompound·protein interactions．Ourmethodassumedthatthe withdifferent shouldbindt0different mechanisms compounds pressor thesemechanismscouldbediffe