板栗的分子标记的研究概况.pdfVIP

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多年生和无性繁殖作物种质资源共享研究 板栗的分子标记研究概况 苑克俊刘庆忠 (山东省果树研究所山东泰安271000) 摘要:目前板栗研究中开发的主要是RAPD标记,也有板栗AFLP标记的 研究报道。本文概述了板栗的DNA提取方法、RAPD标记反应体系、遗传多样 性分析、品种鉴定和分子标记辅助育种等方面的研究进展,提出了在板栗研究中 应注意应用其他的植物分子标记技术,例如SCAR、SSR、CAPS以及新型的 SNP等。 关键词:板栗;DNA;分子标记;RAPD 板栗是一个重要的经济树种,栽培历史悠久,资源丰富。近年来,在板栗的遗传多样 性分析、品种鉴别等各个方面已逐步应用分子生物学技术,开展了分子标记与分子标记辅 助育种等方面的研究工作。 一、RAPD标记 (一)用于板栗RAPD标记开发的DNA提取 DNA的提取是进行分子生物学研究的基础。由于幼嫩组织DNA含量高,次生物质 少,一般选取植物的嫩叶组织提取DNA。板栗营养组织中由于酚类化合物和单宁等次生 物质含量高,DNA提取和纯化非常困难[1]。 沈永宝等的研究结果表明,提取时加6o/off一巯基乙醇的CrAB方法可较容易地提取板 栗冬芽、嫩叶、半木质化韧皮部和老枝韧皮部的DNA,且DNA的纯度较高,其A2m/ A2s。值高于1.8,可满足分子标记实验的要求;对于成熟叶片,则DNA的纯度较低,且 带有褐色,但经过两次酚抽提后A2eo/Am值也达到1.7以上[2]。他们认为,板栗叶片中 酚含量高,保温时极易氧化,是导致DNA提取失败的主要原因。在提取液中必须加大抗 氧化的口—巯基乙醇用量。CTAB和SDS方法提取DNA的效果差别不大。 项艳等通过对板栗基因组DNA几种提取方法获得的DNA质量分析,则认为在提取 最为理想的提取方法,能满足RAPD及其他分子生物学研究的需要口]。他们用高盐低pH ·200· 板栗的分子标记研究概况 为,通过调节提取液的渗透势,使之与细胞核内的渗透势保持平衡,可防止细胞核破裂。 在细胞核裂解前,在提取液中加入2%PVP可将细胞质中的酚类等杂质与细胞核分开、排 除污染。加入2.5%芦—巯基乙醇的提取介质,可有效防止氧化褐变,所提取的DNA絮状 沉淀颜色最白、最易溶解。翁尧富等的研究也表明,在CTAB方法的提取液中加入1% PVP效果理想‘“。 综上所述,对于含酚类物质较高的板栗组织采用CTAB或SDS方法提取DNA时, 宜加大抗氧化的芦—巯基乙醇用量或如人1%~z%的PVP。同时加入2%PVP和2.5%口一 巯基乙醇能有效地抑制多酚类物质氧化,排除多酚类等杂质干扰,获得纯度较高的基因 组DNA。 项艳等还认为,在DNA提取过程中,单宁、多糖等物质与DNA结合成非常黏稠的 胶状物质,用异丙醇沉淀DNA后,4℃条件下离心很难去除这些物质,只有在20℃左右的 温度条件下离心才能有效去除,由于操作过程的温度为室温条件,容易导致DNA降解。 因此,操作过程中动作既要轻又要快o]。另外,由于在乙醇的盐溶液中DNA沉淀的速度 远远大于色素和多糖等其他物质,在加人乙酸钠和无水乙醇时,DNA沉淀出现后将其立 即分离,这样可进一步排除多糖、色素等其他杂质[3]。 (二)板栗RAPD标记的反应体系 目前在板栗的分子生物学研究中RAPD技术的应用较多。RAPD技术应用中的一个 主要问题是重现性差,实验结果容易受到多种因素的影响。因此,建立可重复的RAPD反 应体系对确保实验结果的准确性至关重要。对板票不同品种进行RAPD分析,首先应建立 稳定的反应体系,这样才能将RAPD谱带用于品种间遗传差异比较。项艳等通过实验确定 dNTP、3U DNA聚合酶、2.0mmol/L 物、180/zmol/L Taq MgClz。反应扩增程序为: 尧富等、高捍东等经过大量的实验,也各自确定了一个较为理想的2毗l板栗RAPD反应 体系‘6,7l。 (三)RAPD标记在品种鉴定、遗传多样性和种间亲缘关系分析中的应用 传统的板栗品种划分方法

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