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手性分子的模式识别 王傻许禄 中国科学院长春应用化学研究所，长春130他2 摘要该文应用本实验室所研制的有机化舍物结构解析专家系统ESESOC， 对28个外消旋类化合物 特殊的氨基酸 分子手性中心有关的时称性问题进 行了判别，如对称面、对称点和对称轴等。同时，研制了有关的程序，并用这 些程序对上述化合物的构型进行了自动识别和标示。在此基础上，以手性拓 扑指数为参数，利用Fisher意义下的分析和人工神经网络法，对这些化舍物 的对映体进行了高效液相色谱分离中先后淋洗出的分类判别。结果表明，人 工神经网络法优于Fisher意义下的判别分析。 关键词手性分子手性拓扑指数构型 手性中心Fisher意义下的分析 人工神经网络法 在有机化合物中，特别是天然化合物，许多分子具有手性。手性是由于分子中不对称 原子如碳原子所引起。含有手性的药物分子，两个对映体在活性及代谢等方面往往存在显 著差异，从而使得其中一个异构体可能是有效的，而另一个异构体可能是无效甚至是有害 的。由此，关于手性分子的合成，手性分子的分离，手性分子的生物实验以及手性分子的 药理实验等，近些年来，人们开展了广泛的研究。 为了更有效地进行新化合物的创制，世界上有众多的实验室正在进行定量结构一活性 手性化合物预测预报开展得还较少。本研究，主要是试图在此方面作一些探索。 为了建立构效关系研究中的预测数学模型，人们已经发展了许多结构特征提取的方 法，其中，分子拓扑指数法运用尤为广泛。然而，已有的拓扑指数大部分没有考虑分子的立 体因素，因而这些拓扑指数对于手性分子适应性较差。此文，以本实验室所建立的化合物 活性数据库为基础，并且对本实验室所建议的拓扑指数Am及目前应用最为广泛的分子连 接性指数进行了改进，进而，应用于28个外消旋类化合物，获得了比较满意的结果。 1．原理与方法 为了对手性分子进行有效地表征，那么在该类拓扑指数的计算中将会涉及到如下几个 问题： 1 自动地正确识别分子的不同构型，如“R”型或是“s”型； 2 自动地正确识别手性 原子即不对称中心； 3 制定出有效的表征方案。下面，是对上述诸点的简单介绍。 I．1化台物不同构型的自动识别 在化合物立体异构中分构型异构和构象异构。所谓构型异构是：两分子中原子或原子 团的排列不能通过绕分子中的键的旋转而相互转化；假若能够转化，则为构象异构。为了 ·149· 手性化合物的构效关系研究，本工作仅局限于化合物的构型异构。 对于比较简单的情况，构型可以沿用顺一反异构来表征。但是，对于比较复杂的分子， 如当碳碳双键上碳的连接有4个互不相同的原子或原子团时，用顺一反异构的命名就比较 困难了。因而，本研究中采用的是IUPAC所建议的“R竹、“S”命名规则。 在这种命名规则中，涉及到原子或原子团的优先排序。我们的程序根据如下常见基团 的排序： -CHR2 -CH3 -D -H 来进行化合物不同构型的自动识别。[1】 1．2分子手性中心的判别 手性分子必有互为镜像的构型，不能与镜像重合是手性分子的特征。一个分子是否具 有手性与分子的对称性有关，所以通过考察分子的对称性就能判断它是否具有手性。该工 作，利用本实验室所研制的有机化合物结构解析专家系统ESESOC【2】，可以自动辨别分子所 具有的对称因素： 1 对称面 设想分子中有一平面，它可以把分子切割成互为镜像的两个部分，这个平面就叫对称 面。如，在氯乙烷分子中，一个原子上连接着两个相同的原子氢，在其分子中可以找到一 个对称面，而整个分子关于它是对称的，则此分子没有对映异构体，即为非手性分子。 2 对称中心 设想分子中有一点，从分子的任一顶点 原子或原子团 出发，向这一点连一直线并将 其延长，在离此点的等距离处，遇到一个同样的原子或原子团，这个点就称为分子的对称 中心。具有对称中心的化合物为非手性化合物，因为它的镜像能与之重合。如化合物 E 一 2，4一--Eg基 E 一l，3一环丁二酸具有对称中心，所以它不是手性化合物。 3 对称轴 设想分子中有一条直线，当分子以此直线为轴旋转角度36ff／n n为正整数 后，可以 得到与原来分子同样的形象，则此直线就是该分子的对称轴。然而，在手性分子中往往允 许对称轴这样的对称因素存在，所以对称轴的存在并不能否定分子是手性化合物。但是， 假若分子中具有四重交替对称轴。则化合物与其镜像能够重合，即化合物不是手性分子。 所谓交替四重对称是指：设想有一直线，当分子以此直线为轴旋转36001n角度后，再 用一个垂直此轴的平面为镜面将旋转后的分子反射，如果得到的镜像与原来的分子完全相 同，则此直线就是四重交替对称轴。 在上述算法中，其数学基础主要是图论和群论。 1．3手性拓扑指数 我们尝试了多个拓扑指