温度对中性红和小牛胸腺DNA相互作用的影响.pdfVIP

箜!!星全垦皇坌堑些兰兰查室些堡茎叁————————————一 温度对中性红与小牛胸腺DNA相互作用的影响 刘殿骏 王振新 董绍俊 (中利惕摧看应用化学硼蒴所电分析微：学国家重点实验室，长春 130022) 从生物学和I临床科学的角度来说研究小分子与DNA的相互作用，对于研究小分子的 生物活性以及药物机理研究有重要意义。但大多数小分子与DNA的相互作用的研究都是在 常温下进行的，温度对于小分子与DNA的相互作用的模式的影响研究很少。这篇文章用光 DNA)的相互作用的影响。 谱法和电化学法研究了温度对中性红(NR)与小牛胸腺DNA(CT DNA的浓度比)，红移到563nm。在CTDNA存在下，NR的诱导园二色谱(ICD 的浓度与CT DNA 谱)有一个负吸收峰，峰位为519(一)nm。光谱实验表明在低的R值下NR嵌入到CT 碱基内部，NR的显色团嵌入G-C碱基对并垂直与核酸双螺旋的对称轴“’…。在R=0．05时， illll，NR的诱导cD谱有两个吸收峰峰位为 NR最大吸收波长(^。)从531Ⅻ紫移到507 571(+)，519(一)m，表明NR在核酸的双螺旋表面发生聚集“’…。 CTDNA是一种自然形成DNA双螺旋，它不含有连续的广阔的dA．dT区，因此并不表 现出熔融前行为。CTDNA—NR(R=O．005)化合物在不同温度下的紫外区间cD光谱只有微 DNA—NR的二级结构影响很小。 小变化，表明温度对CT V处有一个NR DNA相互作用的微分脉冲伏安，在E一0．585 不同温度下的NR与CT DNA浓度增加， 的还原峰。CTDNA存在下，没有新的氧化还原峰产生，随着溶液中CT DNA形成非电活性物质，其不能在电极上发 NR还原峰的峰电流逐渐降低，说明NR与CT DNA的DPV曲线，峰电流有所提高，说明在40℃下 生氧化还原反应。在40C时NR-CT Nl{与CTDNA的作用模式有所改变。 nm， NR—CTDNA在5C时的吸收光谱与其在25℃时类似，仅表现为最大吸收波长红移2 DNA在40℃时的吸收光谱发生了一定变化，吸收强度下降10％ 且吸光度稍有提高。NR-CT 并且在508nm出现一肩峰，说明NR与DNA的作用模式随温度的升高发生了变化。最大吸 DNA外部结合形成NR聚合物的光谱特征，说明在高温下有部 收波长在508nm是NIl和CT 分NR从碱基内部出来，并且相互之间形成聚合物。 在R=O．01时，NR的诱导cD光谱的强度对温度的变化很敏感。NR在0℃时的ICD有 三个峰，峰位为：455，519和595(sh)nm。当温度从0上升40℃时，所有的峰强度 均随温度的升高而降低。 ICD光谱的变化表明NR的发色团与核酸的结合方向发生变化。 B．Norden等人发现如果嵌入剂的发色团与DNA双螺旋的对称轴平行(Y=0。)则产生正 的ICD峰，当嵌入剂处于碱基对中间且发色团与DNA双螺旋的对称轴垂直(Y=90。)则产 生负的ICD峰。提高双螺旋的折角将有助与ICD强度数量级的提高。双螺旋内部碱基对 的分离将使ICD强度数量级的下降。在嵌入范围内嵌入模式的的改变将使ICD的信号发 生改变。有两种最基本的改变ICD的途径为：(1)染料发色团在平面内的旋转，(2)嵌入 位置的侧链取代。显然与不同碱基对的结合将产生不同的ICD信号。从实验数据分析， 在我们的观测温度下DNA的结构没有发生变化，因此发色团的旋转将对