尼克酰胺核苷构象稳定性的理论研究.pdfVIP

2O15年 1月 四川大学学报(自然科学版) Jan．2015 第52卷 第 1期 JournalofSichuanUniversity (NaturalScienceEdition) Vo1．52 NO．1 doi：103969／j．issn．0490—6756．2015．01．023 尼克酰胺核苷构象稳定性的理论研究 李强根 ，薛 英 (1．四川师范大学化学与材料科学学院，成都 610066；2．四川I大学化学学院，成都 610064) 摘 要：采用从头算 (HF与MP2)和密度泛函理论 (DFT)方法，在 3—21G和 6—31+G*水平 上研 究了尼克酰胺核苷 (NR)的构 象．分别探讨 了在气相及液相 (水和氯仿)中NR分子和一 水合物异构体的相对稳定性 ，分析 了溶剂分子的参与对 NR异构体 的相对稳定性和几何结构 参数的影响．结果表明：孤立的NR分子在气相 中存在 36种稳定构象，其中最稳定的为南式 构象NR-S，而最稳定的北式构象为 NR-K’，能量比前者高出 1O．6kJ／mo1(AG。)．NR分 子 中酰胺基 团优势构象为反式 ，00，P或 y参数的改变可以为 NR分子提供大约 8．4～23．7 kJ／mol(AG。)稳定化能．不管是南式还是北式褶皱，最稳定 NR分子构象中都存在多根分 子 内氢键 ，且 5，_OH基 团都为顺式构象(7≈一63。)．溶剂效应使一部分 NR分子构象相对稳 定性 降低 ，而一部分则升高，改变了NR分子各构象的相对稳 定性顺序．水分子的加入与酰 胺基 团结合形成氢键 ，对 NR分子的构型影响较 大，而与糖环上羟基结合形成氢键，则影响 较 小 ． 关键词 ：尼 克酰胺核苷；构象稳定性 ；平滑势能面扫描 ；格子搜寻方法；密度泛函理论 ；从头 算 Hartree—Fock方法；溶剂效应 中图分类号 ：O641 文献标识码 ：A 文章编号 ：0490—6756(2015)01—0123—11 Theoreticalstudieson theconformationalpreferencesof nicotinamideriboside LIQiang—Gen 。XUE Ying (1．CollegeofChemistryandMaterialScience，SichuanNormalUniversity，Chengdu610066，China； 2．CollegeofChemistry，SichuanUniversity，Chengdu610064，China) Abstract：A conformationanalysisonthenicotinamideriboside(NR)ingasphaseandinwateraswel1as chloroform wasperformedbyabinitio(HFandMP2)anddensityfunctiona1theory(DFT)methodsat3— 21G and6—31+G* 1eve1．Theeffectsofone—watermoleculeonrelativestabilities，conformationalPa— rametersofNR wereanalyzed．Theresultsindicatethatthereare36stableconformersforNR inthegas phase．ThesouthconformerNR-S isthemoststableform ofallconformationsin thegasphase ． The