DXS8378基因座等位基因分型标准物的制备及其遗传多态性.pdfVIP

维普资讯 第29卷第3期 西 安 交 通 大 学 学 报 (医 学 版 ) Vo1．29NO．3 2008年 6月 JournalofXi’anJiaotongUniversity(M edicalSciences) Jun．2008 DXS8378基因座等位基因分型 标准物的制备及其遗传多态性 沈 靓 ，魏曙光 一，王 科 ，李正望 ，赖江华 (1．西安交通大学医学院法医系；2．卫生部法医学重点实验室，陕西西安，710061) 摘要 ：目的 采用分子克隆技术制备 x染色体 DXS8378位点等位基 因分型标准物 ，了解该 STR位点在 中国云南傈 僳、普米、德 昂三个群体的遗传多态性及其法医学应用价值 。方法 用 PCR扩增和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ，分 离各等位基 因片段 ，回收纯化后进行二次扩增 ，分别插入到 pGEM@一TEasy质粒载体中，DNA测序证实插入片段 的 大小和结构，等位基因片段按 国际标准进行命名后 ，经转化、扩大培养、扩增及再鉴定后制备 出该位点的等位基 因分 型标准物 ，进行群体遗传学研究。结果 得到 DXS8378位点分型标准物 ，应用此分型标准物研究中国云南傈僳、普 米、德昂族人群 中基 因型分布频率 。结论 该法制备的STR位点等位基 因分型标准物适用于法医学鉴定实践 ，具有 较高的应用价值 ，适合于群体遗传学的分析 。 关键词 ：分型标准物 ；短串联重复序列；重组质粒 ；遗传多态性 ；DXS8378 中图分类号 ：R395．2 文献标识码 ：A 文章编号 ：1671—8259(2008)03—0252—04 ConstructionofDXS8378allelicladderandthegenetic polymorphism inthreeChinesepopulations ShenLiahg ，W eiShuguang ，W angKe ，LiZhengkun ，LaiJianghua’ (1．ForensicDepartment，MedicalSchoolofXi’anJiaotongUniversity； 2．theKeyLaboratoryoftheMinistryofHealthforForensicScience，Xi’an710061，China) ABSTRACT：0bjective Toinvestigatethegeneticpolymorphism ofDXS8378STRlocusofchromosomeXin ChineseLisu，PumiandDe’angpopulationsinYunnanandconstructrelativestandardallelicladders．Methods Afterbeingamplified by．PCR，differentSTR allelicfragm entswere isolatedfrom thePAG electrophoresis．The STR allelicfragmentswereextractedbykitandreamplifiedbyPCR toobtainpurifiedallelicfragments．Next，the purifiedallelicfragmentsweresubclonedindividuallyintothePUC plasmidvectors，andthesizeandstructureofthe insertswereconfirmedbytheanalysisoftheirDNA sequences．ThenwetransfecteditintocompetentE ．coliDH5 口