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免费软件在药物设计实验中的应用.pdf

第 33卷 第 12期 实 验 室 研 究 与 探 索 Vol_33NO.12 2014年 12月 RESEARCH AND EXPL0RATION IN LAB0RAT0RY Dec.2014 免费软件在药物设计实验 中的应用 李卫华, 刘桂霞, 程家高, 唐 赘 (华东理工大学 药学院,上海 200237) 摘 要 :计算机辅助药物设计是一 门新兴的交叉学科 ,不仅理论性强,而且注重 实践动手能力。为巩 固 理论课的教学成果 ,增强学生的实践操作能力和学习兴趣 ,我们为药学专业本科生开设 了 “药物设计实 验”课程。制药企业和学术界的药物设计平 台通常采用商业软件包。虽然商业软件功能丰富.但也存 在费用昂贵 、对硬件要求高等问题 ,不适用于大规模的实验教学。过去几年我们尝试将一些能免费获取 的软件应用于 “药物设计 实验”课程的教学,取得 了较好的效果。论文根据该课程 实验的设置 内容 ,介 绍 了这些免 费软件在药物设计实验中的应用 ,具有较好的推广价值。 关键词 :计算机辅助药物设计 ;药物设计 实验 ;免费软件 ;实验教学 中图分类号 :G642.0 文献标志码 :A 文章编号:1006—7167(2014)12—0197—04 ApplicationofFreeware inDrugDesignExperimentalCourse LIWei—hua, LIUGui—xia, CHENGJia—gao, TANGYun (SchoolofPharmacy,EastChinaUniversityofScienceandTechnology,Shanghai200237,China) Abstract:ComputeraideddrugdesignisanewinterdisciplinarySUbject,whichhasnotonlysoundtheoreticalbasisbut also requiresstrong practicalability.Forstrengthening the effectsofthe theoreticalclass teaching,increasing the students’practicalability,andenhancingtheirinterest,wehaveofferedacoursecalledDrugDesignExperimentsfor undergraduates.Commercialsoftwarepackagesaremostoftenused inpharmaceuticalindustryandacademics.Although theyhavepowerfulfunctions,thesesoftwarepackagesarecostlyandhigh—demandingofrhardware,whichmakesthem unsuitableforclassteaching.Inthepastfewyears,wehavetriedtoapplyfreewaretoourcourseteaching,andobtained goodresults.Accordingtothecontentsofthecourse,thedetailedapplicationsofsomefreepopularmolecularmodeling softwareinthecourseareintroducedinthispaper.Ourexperiencecanbeextendedtoothersimilarcourses. Key words:computeraideddrugdesign;drugdesignexperiment;freeware;experimentteaching 物信息,进行药物的发现和设计 已成为药物研发 的一 0 引 言 种主要方法 ¨。J。利用计算机辅助药物设

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