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蛋白质组学及其技术进展 Proteomics and Its Developments in Techniques 王锋 郭尧君* 中国科学院生物物理研究所 北京 100101 E-mail:yaoj un .g@263 .net 摘 要 蛋白质组学是系统生物学重要基础和组成部分之一 近年来其研究技术进展迅猛 本文分析了蛋白质 组学研究的必要性 长期性 复杂性和挑战性 重点综述了蛋白质组学一些研究技术及其在近年的进展 关键词 系统生物学 蛋白质组学 双向电泳 分子扫描 1 引 言 种各样的性质 包括序列 表达量 修饰状态 与其 它蛋白之间的相互作用 活性 亚细胞分布和结构等 [4,5] 近年来生命科学领域发生了革命性的变化 对于 主要包括三个部分 表达蛋白质组学 Expression Proteomics 细胞活动的研究正从传统的还原式研究转向整体式研 结构蛋白质组学 [1,4,6] 究 因为仅仅依靠对细胞各个组成成分的孤立研究是 和功能蛋白质组学 表达 无法完全了解细胞这一 复杂 系统是如何行使功能 蛋白质组学是指对一个指定的细胞 组织或生物所产 的[1,2] 生全部蛋白质的鉴定 结构蛋白质组学是指对上述全 正是在这种情况下系统生物学应运而生 系统生物学是通过对细胞所有组分的定量描述从 部蛋白质精确三维结构的测定 功能蛋白质组学的任 而在系统水平上来了解生命活动的一门新型交叉学 务是阐明上述全部蛋白质所形成的类似于电路的功能 科 它以功能基因组学和蛋白质组学为基础 以各种 网络 经典和新萌生的技术为重要工具 包括实验观察和数 学建模的反复迭代过程 通过数学模型来描述和预测 3 蛋白质组学研究的必要性复杂性 长期 生物系统的动态行为[2] 性与挑战性 蛋白质组学是系统生物学的重要基础和组成部分 之一 在后基因组时代的地位尤为突出 与传统的蛋 蛋白质组学研究具有非常重要的意义 因为基因 白质化学不同之处是在于它是在生物体或其细胞的整 的产物 蛋白质才是生物体执行各种各样复杂生理 体蛋白质水平上进行研究 从机体或细胞的蛋白质整 功能的主体 而具有相同基因组的个体形态差异可以 体活动来阐明生命活动的基本规律 非常大 仅仅知道基因组是无法了解生命活动过程的 [7]这是因为无法根据mRNA的表达水平预测蛋白的 2 蛋白质组学定义的发展 表达水平 也不能仅仅通过基因序列确定蛋白质的修 饰和加工 而且蛋白质组是不断变化的 决定并反映 1994年澳大利亚Macquarie大学的科学家 Marc了生命活动的状态[2,8] 另外 蛋白质组分析是从分子 Wilkins提出了蛋白质组 Proteome的概念 Proteome [7] 水平了解疾病的捷径