Partial+Hessian+Vibrational+Analysis(PHVA)的原理、方法及在地质学中应用.pdfVIP

Partial+Hessian+Vibrational+Analysis(PHVA)的原理、方法及在地质学中应用.pdf

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288 矿 物 学 报 2009年 PartialHessianVibrational 原理、方法及在地质学中的应用 原杰,刘耘 (中国科学院地球化学研究所矿床地球化学国家重点实验室,贵州寅阳550002) PHVA在简化模型大小,提高计算效率在计 算科学有重要的地位。应用PHVA方法可以求分 巧=(芝乏) 子簇模型兴趣区的简谐频率,可以用来研究超大 分子或矿物的局部振动性质,可用于化学反应动 其中,%=毒羔,g为质权坐标。 力学及同位素分馏系数计算等。 将BB(‘区内’相关)的力常数矩阵保留,BC 这种方法的原始思想由Pacchione等(1992)(‘区间’相关)和CB的力常数设置为零,并将CC 提出并首先应用于表面吸附态的振动分析。 的力常数设置为8=lO。8au的对角阵: o Head(1994)在研究H20在Al(111)表面的振动 华聃 \ 时正式命名。随后,Head(1997)又将该方法迸一 耻【o磁。j 步的拓展至表面吸附分子n珊i能级的研究。“ o rs 01 和Jensen(2002)将其推广至化学反应的振动熵 o o 其中,磁c=I ; l,s=lo一觚 和焓的计算中,并且首先将该方法写入了 Ioo £J GAMESS程序。GhyseIs等(2007)把该方法发展 然后用差分法求得3ⅣB.3(Ⅳ。为B区内原子 成为用来精确优化超大体系局域结构及频率性质 数)个主要与B区原子相关的简谐频率。 b10ck 的mobileHessiaIl(MBH)方法。Emil和Jing (2007)在Q—chem中实现了兴趣区电子积分的 直接将slater行列式中的BB区的电子进行积分 PHVA方法。 得到能量。电子积分的slater行列式可表示为: 1 PHVA方法的主要思想和理论 s^=(喜:芝) 依据 然后再对位移求二阶导数得到力常数矩阵, 该方法的主要思想就是从体系的能量二阶导 进一步对角化得到频率。最终将会给出3NB个 (力常数)矩阵中计算兴趣区原子的简谐频率,以 主要与B区原子相关的简谐频率。 较精确地获得与频率有关的局域物理化学参数。 由于原子数相对于整体变少,因此在用PH— 任何软件中,就算频率的过程都可简单分为 vA计算频率时,有显著节省机时和成本的优点 ①优化电子结构,得到一组电子的Slater行列式,(“和Jensen,2002)。易见两种算法之间是有差 ②以Slater行列式为基础,求得能量对位移的二 别的:①两种算法是在不同的计算步骤上进行了 阶导数的力常数矩阵,③对角化力常数矩阵,获得 PHvA计算;②两种算法给出的频率个数是不 频率。 同的。 在GAMEsS和Q—Ch啪软件应用PHVA来获

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