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2008年第66卷 化学学报 V01.66,2008
第7期.817~822 A(了ACHIMICASⅣTcA NO.7,817~822
·研究简报·
金属离子对HIV.1整合酶与硫氮硫扎平抑制剂作用模式影响的
分子模拟研究
王丽东口 王存新柏
(4重庆工商大学药物化学与化学生物学研究中心重庆400067)
P北京工业大学生命科学与生物工程学院北京100022)
摘要HIV.1整合酶(矾)通过依赖金属离子的两步反应将病毒DNA整合入宿主细胞中.结合于HIV.1上的金属离子个
数的变化直接影响整合酶与抑制剂之间的结合.用同源模建方法搭建了每条单链核心区具有两个M92+的
(2Mg—IN.Core)和具有一个M92+的HIV.1IN二聚体核心区模型(1Mg—IN.Core).通过分子对接分别得到它们与硫氮硫扎
平类化合物能量较低的复合物结构,并对对接结果进行了比较.研究发现:当整合酶中结合的M,+个数改变时,它与
抑制剂的结合模式也会发生很大的变化:抑制剂能够特异且稳定地与2Mg—IN.Core模型的活性位点结合;同时与
与抑制剂的复合物平均结构进行了2000
这个M92+对IN与硫氮硫扎平抑制剂之间的结合有较大影响.
关键词HIV.1整合酶;金属离子;硫氮硫扎平类抑制剂;分子模拟
ofMetalIonson betweenHIV一1
ontheInfluence Interaction
Study
and InhibitorswithMolecular
IntegraseThiazoIothiazepine
USimulationsdohationteMMetn0
WANG,Cun—Xin术≯
WANG,Li—Don94
ResearchCenter andBusiness
(4 ofPharmaceutical Technology University,
Chemistry&Chemobiology,Chongqing
Chongqing400067)
100022)
(bCollegeofLifeScience&Bioengineering,BeijingUniversityofTechnology,BeUing
AbstractHW-1 viralDNAintohostcells two metal
integrase(IN)integrates throughsteps ions—dependent
INhas
reactions.nenumberofmetalions withHIV-1 very influenceoninteractions
binding important
betweenHIV.1INandinhibitors.At HIv.1INdimercore and
present,two st
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