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第 9卷 第 1期 北华大学学报 自然科学版 Vol. 9 No. 1
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2008年 2 月 JOURNAL OF B E IHUA UN IV ER SITY N atu ral Science Edition Feb. 2008
文章编号 :(2008) 0 100 12 04
主分量分析法和 K近邻法应用于
基因芯片数据分析
胡 煜
(广东工贸职业技术学院 ,广东 广州 510500)
( )
摘要 :应用主分量分析法和 K近邻法对基因芯片 微阵列 数据进行分析. 主分量分析法是一种提取海量数据有
效特征的有效方法 ,可以获得与原来基因芯片数据更为接近的成分的提取特征的效果. 实验结果表明 ,用主分量
分析法预先对数据处理可以提高基因芯片数据分析的准确性.
关键词 :基因芯片 ;主分量分析 ; K近邻法
中图分类号 : O235 文献标识码 : A
Apply ing Pr inc iple Componen t Ana ly sis and KNearest
Ne ighbor on Da ta Ana ly sis of Gene Ch ip
HU Yu
( Guangdong Voca tiona l Colleg e of Industry and Comm erce, Guangzhou 510500, Ch ina)
A b stract: The data of gene ch ip (m icoarray) is analyzed by app lying the p rincip le componen t analysis ( PCA )
and KN eare st N eighbor. PCA , a develop ed and efficien t m ethod for analyzing num erou s data, can extract the
featu re s m uch clo ser to the gene data exp re ssion of originality. It show s that when PCA is p red ispo sing of the
data set, the accu racy of cla ssification of ga so line is imp roved noticeab ly.
Key words: Gene ch ip ; Princip le componen t analysis ( PCA ) ; KN eare st N eighbor ( KNN )
1 引 言
(
基因表达数据通常是测定几十个样本中成千上万个基因的表达值 ,得到的数据矩阵的变量数 基因
)
数 通常为几千个 ,而样本数通常为 70 ～80个. 所以,直接对这么庞大的矩阵使用分
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