4蛋白质共价结构.pdfVIP

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第 4 章 蛋白质的共价结构 要点: 一、肽键的结构和特性 二、一级结构的测定 一、 蛋白质通论 蛋白质的化学组成 氮为蛋白质的特征元素,将提取并纯化的蛋 白质用凯氏定氮法测定氮的含量,然后通过下列 公式可以计算蛋白质的含量: 蛋白质含量(mg/ml)= 蛋白氮(mg/ml)×6.25 (或= 蛋白氮(mg/ml)÷16%) 蛋白质分类 单纯蛋白质 缀合蛋白质=蛋白质 + 辅基 脂蛋白 糖蛋白 磷蛋白 血红素蛋白 黄素蛋白 金属蛋白 蛋白质:大小差异大 残基数 细胞色素c 肌连蛋白 蛋白质中氨基酸残基数的估算 简单蛋白质:残基数 = Mw ÷110 20种常见氨基酸的平均分子量为138 组成蛋白质的氨基酸的平均分子量为128 每个氨基酸残基的平均分子量为110 蛋白质结构层次 二级结构:多肽链 借助于氢键排列成 有规律的、局部的 结构 三级结构:多肽链借助各种 四级结构:寡聚蛋白质亚基间 一级结构: 非共价键弯曲、折叠成具有 的结合 氨基酸序列 特定走向的紧密球状构象 概念:单体蛋白;多亚基/寡聚 蛋白 二、 肽键的结构和特性 肽的形成 肽由氨基酸缩合而成;寡肽,多肽 与蛋白质相比肽较小 (M 10 kDa) w 肽的末端 氨基端 羧基端 N-端 C-端 肽的命名和酸碱特性 • 从N-端开始 • x氨酰x氨酰x氨酰 • 三字母缩写为: Ala-Glu-Gly-Lys • 多肽的酸碱表现取决 于游离的α-氨基和 α-羧基及可电离的R 基,但R基的pK 可能 a 有变化 肽:功能的多样性 • 激素 信息激素 – 胰岛素 insulin – 催产素 oxytocin – 性外激素 • 神经肽 – P 物质 (痛觉传递) • 抗生素 竞争 – 多链丝霉素 – 杆菌肽素 • 毒素 保护 –鹅膏菌素(蘑菇) –氯毒素(蝎子) –肉毒素(细菌) 肽键的特点 对氨基酸、二肽、三肽晶体的X射线衍射研究证实: – 肽键长比C-N单键短,比C=N双键长 – 肽键连接的原子共平面,肽键不能自由旋转 肽基的4个原子和2个相邻 的Cα原子形成刚性平面, 即酰胺平面(amide plane) 或肽平面(peptide plane)。 Cα连接两个酰 胺平面。 肽键的共振 • 羧基氧和氨基氮间有共 振/部分共用两对电子 • 中间态的酰胺氮带部分正 电荷,羰基氧

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