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后基因组时代的生物信息学发展 高媛 东北林业大学生命学院 摘 要 DNA序列中的遗传语言规律。 分利用各种有效手段寻找新药,改变传统的 生物信息学是随着人类基因组计划(HGP)的启 寻找新药的途径,即除了利用生物学和化学 动而兴起的一门新的生命科学与计算机科学 3、生物信息学的主要研究内容 手段外,还充分利用现有的生物信息学技术 的交叉学科。HGP的完成标志着进入了后基因 来寻找,合成新药。 (1)序列比对：在生物信息学研究中, 组时代，这也赋予了生物信息学新的任务和 (2)其它领域：在寄生虫与流行病学 比对是最常用和最经典的研究手段。最常 内涵。 研究、农作物基因组分析、神经科学研究 见的比对是蛋白质序列之间或核酸序列之 关键词 中均有广泛应用。 间的两两比对,通过比较两个序列之间的相 生物信息学；后基因组时代；计算机技术；个 似区域和保守性位点,寻找二者可能的分子 体基因组时代 进化关系。 5、生物信息学的发展阶段 (2)蛋白质结构预测：蛋白质分子是 生物信息学的发展历程大致经历了三 由20种不同的氨基酸通过共价键连接而成 个阶段： 的线性多肽链,然而天然的球状蛋白质分子 (1)前基因组时代:这一阶段生物信息学 的水溶液中并不是一条走向无规则的松散 的主要工作包括生物数据库的建立,检索工 肽链,每一种蛋白质在天然条件下都有自己 具的开发以及DNA和蛋白质序列分析。 特定的空间结构，预测其结构对之后的认 (2)基因组时代:这一阶段生物信息学的 识和研究也具有重要意义。 主要工作是大量核苷酸序列测定、分析、新 (3)基因识别：HGP的重要内容之一是 基因寻找和识别,以因特网为基础的网络数 1、生物信息学产生的背景 识别全部人类即基因组中发生转录表达的 据库系统的建立和交互界面的开发以及基 1990年，在美国正式启动了跨世纪的 功能单位,并对其结构进行研究。给定一 因组序列信息的提取分析等。 “人类基因组计划”（HGP），破译人类自身 DNA序列,要找出哪一段是编码区,它所编 (3)后基因组时代:这一阶段生物信息学 遗传秘密。1995年，在HGP第一个五年总 码的蛋白质的氨基酸排列顺序(一级结构)就 的主要研究工作将包括蛋白质组学研究及 结报告中，给出了一个较为完整的定义：生 清楚了,这为预测它的结构与功能奠定了基 人类基因组注释。2003年4月15日，中、 物信息学是一门交叉科学，它包含了生物 础 。 美、日、英、法、德六国联合宣布,人 信息的获取、加工、存储、分配、分析、解 (4)非编码区分析和DNA语言研究： 类基因组序列图完成，昭示着人类已从基 释等在内的所有方面，它综合运用数学、计 在人类基因组中,编码部分只占总序列的很 因组时代步入后基因组时代。 算机和生物学的各种工具，来阐明大量数 少一部分,其它非编