mRNA的序列、结构以及翻译速率和蛋白质结构的关系.pdfVIP

维普资讯 @ 钢一 l 动 鞠 学 研 究 1999．Dee．2．0 (6}：457~461 53—10~ ／q 0254—5853 ＆ 专 mRNA的序列、结构以及翻译速率与蛋 白质结构的关系 7 塑盟堂 剖达全 (中国科学院昆明对犄研究所细胞与分子进化开放研究宴验室 昆明 栅 23) 摘要：mRNA所包含的校苷酸序列通过三联捧密码子决定了蛋白质的氨基酸序列。但是，由于对氨基酸同 义密码使用频率上的差异，密码子与反密码子相互作用效率上的不同，以及密码子上下文关系和mRNA不同区 域二缀结构上的差异．造成了校糖捧对mRNA不同区域翻译速度上的差异，加之共翻译折叠的作用．使得mR． NA的序列和结构影响着蛋白质空间结构的形成。 美奠词。挚B礁；同义密码；窜强速塞J苎曼堡堑量；蕈自唇绮曲 僵列．钒抽． 中圈分类号： 55 文膏I标识码：A 文章奠号：025．4—5853(1999)06—0457—05 遗传信息由DNA到RNA再到蛋白质的传递 的稀有密码子的使用与蛋白质结构域的连接区和规 过程，是分子生物学的研究核心，通常称之为分子 则二级结构单元的连接区有关，翻译速率在这些连 生物学的中心法则 。经过多年的研究，由DNA到 接区会降低 (T~ araj等，1996a)；在翻译蛋白质 RNA再到多肽链的合成过程．包括怎样由3个核 不同二级结构 (a一螺旋与8一折叠)时，mRNA 苷酸序列决定 1个氨基酸的所谓遗传密码，已经基 区段的翻译速率有所不同 (Than~ 等，t996h)； 本清楚。但是以～定氨基酸序列排列形成的多肽链 gt一螺旋与8一折叠的N端与C端的氨基酸密码子 并不是活性蛋白质分子．它必须折叠成一定的空间 特殊密码位的核昔酸种类也会有某种偏 向性 结构才能成为具有特定生物功能的蛋白质分子。70 (Branak等，1996)，这些均说明蛋 白质折叠方式 年代初，Anfisen因提出蛋 白质的氨基酸序列包含 与 mRNA序列之间存在一定 的相关性。此外， 有足够的信息去决定它的空间结构的假说而获诺贝 mRNA二级结构 自身会影响到肽链台成时的延伸 尔奖 (Anfisen．1973)。但是，一些研究者发现存 速率 (Le等，1993)，表明mRNA二级结构与蛋 在着氨基酸序列相同但构象不同的蛋白质，以及构 白质空间结构之间存在某种相关性。 象相似而氨基酸序列相差显著的蛋 白质 (Tefling， 对mRNA的序列、结构和与其编码的蛋 白质 1996)。说明氨基酸序列并不是决定蛋 白质空间结 的空间结构关系的研究不但可 以完善和补充中心法 构的充分条件，意昧着除氨基酸序列以外的其他信 则．提高蛋白质结构预测的准确率，而且对蛋白质 息对蛋白质空间结构的形成也是重要的。这种信息 工程和遗传工程都具有巨大的实用价值。本文结合 很有可能存在于mRNA的序列和结构中。 我们实验室的一些工作，就该方面的研究进展作一 遗传密码的简井性主要是与密码子的第 3位 概述。 — — 无声”密码位有关，这使得编码蛋白质的核 1 影响翻译速率的几大因素 酸序列有更大的自由度，允许mRNA携带除编码 相应氨基酸以外的更大的信息量。因此，在探索蛋 研究表 明，mRNA在核糖体上翻译时的速率 白质折叠机理和预测蛋 白质结构时，我们必须考虑 是不均匀的 (Varenne等，1984)，即对于不同的 到mRNA的序列、结构及其对翻译过程和翻译速