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分子育種(MAS)全球發展現況與趨勢
1970 年代晚期,以 DNA 為基礎的基因標記出現,科學家開始針對特定物
種大量尋找其基因物質上的標記,並且使用這些標記去偵測與目標性狀之間的關
聯性,讓傳統表現型的育種方式走向基因型的選拔,由基因層次達成培育新品種
的目的,分子標記輔助育種(Marker-assisted Selection, MAS) 自此從理想幻化成
真,同時也開創了一個全新的學術研究領域。
一、分子標記系統概述
分子標記輔助育種依據個體間分子層次的差異包括重複性序列、點突變、
插入/缺失等,利用與目標性狀連鎖或高度相關的特性進行品種選拔,目前已經
有多種分子標記系統成功建立,包括廣為人知的限制片段長度多型性 (Restriction
Fragment Length Polymorphism, RFLP )、隨機增幅多型性DNA(Random Amplified
Polymorphic DNA, RAPD )、增幅片段長度多型性(Amplification Fragment Length
Polymorphism, AFLP )等。而從這些原有的分子標記系統衍伸出來的系統則有:
包含 PCR 與 RFLP 兩項技術的限制酵素切割擴增片段多型性(Cleaved Amplified
Polymorphic Sequence, CAPS)以及將 RAPD 或 AFLP 方式產生出的 DNA 條帶進
行回收與定序的序列特徵化增幅區域(Sequence Characterized Amplified Region,
SCAR) 。
此外,隨著 DNA 序列的可獲得性越來越高,從已知的序列設計引子,以
PCR 增幅基因體片段的可能性也得以 提升,例如單核苷酸多型性 (Single
nucleotide Polymorphism, SNP) ,可針對同一位點不同對偶基因之間單一核苷酸的
差異開發做為分子標記。然而增幅已知序列進行基因型辨別時,並非所有的基因
座都具有多型性而可供鑑定,因此若選擇高度變異性的 DNA 片段如屬於串聯重
複 序 列 (tandem repeats) 的 微 衛 星 標 記 (microsatellite) 、 轉 座 元 素(transposable
elements)作為分子標記,將可以增加測得多型性的可能性,進而達到遺傳相似性
分析及遺傳連鎖圖譜建構等用途。
在基因型高通量分析技術(High-throughput Techniques)的發展上,SNP 整合
相關基因分析技術如 DNA Chip ,可以達到快速、有效率的基因型分析功效,在
MAS 發展作為永續保存物種和增加作物基因物質利用時,扮演著重要的角色,
另外值得一提的是,高通量分析時需要大量處理分析樣品,技術層次上已跳脫出
許多舊有的分析系統,需要更先進的設備、試劑、電腦分析軟體等協助,而這些
軟、硬體設施,甚至技術本身都有可能申請專利,因此這也代表著未來分子標記
技術在不斷的演進下,可能在選用 MAS 技術的同時,還必須考慮智慧財產權的
問題。
二、MAS 的育種優勢
在有足夠可用之基因標記的前提下,MAS 的主要育種優勢包括:
1. 針對多基因控制之性狀,傳統育種方式難以篩選出最佳表現之品系,尤其是
抗蟲抗病之性狀,在此情況下,MAS 成為可直接偵測此群基因以確定表現強
度的有力工具。
2. 無需等待生物體表現基因,MAS 便可及早確定該品種是否具有目標性狀,這
對於生長週期長的生物,如林木,更具使用優勢。
3. 在傳統育種程序中,需再進行一次自交才可確認原品系是否帶有隱性基因而
影響子代的性狀表現,MAS 則可直接確認。
4. 如某些疾病乃特定季節或在特地區域才會發生,利用 MAS 則可不受時空之限
制,進行季節型/地域型性狀之篩選育種。
5. MAS 可同時篩選不同之目標性狀。
儘管使用 MAS 有上述優勢,但對於是否要應用 MAS 技術於育種,並無一
體適用的標準供決策,因為在不同的目標物種和時空背景,如性狀的重要性、天
然種原的豐富性、人力素質和硬體設施的充足性等,皆有不同的考量權重。然而,
有價值的育種計畫大多同時針對數個性狀進行選拔,且重要的抗病抗蟲性狀又多
得應用 MAS 來篩選,所以 MAS 仍是相當重要之育種工具。
三、MAS 在作物上的應用
二十多年來,科學家藉由分子標記的技術,對
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