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洞庭青鲫等5个鲫品系线粒体ATPase基因序列的比较分析.pdf
第41卷 第 1期 淡 水 渔 业 2011年 1月
V01.41 No.1 FreshwaterFisheries Jan.2011
洞庭青鲫等5个鲫品系线粒体 ATPase基因
序列的比较分析
刘良国,杨品红 ,杨春英 ,王文彬,韩 庆
(1.湖南文理学院生命科学学院,湖南常德 415000;
2.湖南省水产工程技术研究中心,湖南常德 415000)
摘要:运用PCR扩增 、克隆 、测序等技术对洞庭青鲫 (Carassiusauratusvar.Dongtingking)、彭泽鲫 (eauratus
var.Pengze)、普通鲫 (C.aurat~s)、红鲫 (C.auratusvar.red)、日本 白鲫 (C.auratuscuvieri)等 5个鲫品系线粒体
DNAATPase8和ATPase6基因序列的碱基组成、变异情况和分子系统进化进行了比较分析。结果显示:5个鲫品
系线粒体DNAATPase8/6基因序列碱基的平均组成为A:32.6%,C:25.5%,G:12.6%,T:29.4%,序列分
歧率为0.5%一4.0%,其 中普通鲫和 日本 白鲫 的分歧率最大 (4.O%),洞庭青鲫与彭泽鲫的分歧率最小
(0.5%)。在5个鲫品系中,红鲫和普通鲫的亲缘关系较近,洞庭青鲫与彭泽鲫亲缘关系较近,而它们与白鲫的
亲缘关系则较远,推测红鲫、洞庭青鲫和彭泽鲫均起源于普通鲫。5个鲫品系在线粒体 DNAATPase8/6基因序
列碱基位点上的差异可以作为区分不同鲫品系的分子遗传标记。
关键词:线粒体ATPase基因;洞庭青鲫 (Carassiusauratusvar.Dongtingking);鲫品系;系统进化
中图分类号:s965.117;Q347 文献标识码:A 文章编号:1000-6907一(2011)01-0036-07
ComparativeanalysisofthemitochondrialATPasegenesof
fivestrainsofCarassiusauratusincludingDongtingkingcruciancarp
LIULiang—guo,YANGPin—hong,YANGChun.ying,WANGWen—bin,HANQing
(1.Collegeof Science,HunanUniversityofArtsandScience,Changde,Hunan 415000;
2.HunanProvinceFisheriesEngineeringTechnologicalCentre,Changde,Hunan 415000)
Abstract:Thebasecomposition,variationandphylogenyofthemitochondrialATPase8andATPase6werecomparedand
analyzedamongfivestrainsofCarassiusauratll$(Dongtingkingcroeiancarp,Pengzecruciancarp,crueiancarp,Red
erueiancaprandJapaneseeruciancarp)byPCRamplification,cloneandsequencing.InthefivestrainsofCarassiusau—
ratus,thepercentagesofaveragebasecompositionsofthemitochondrialATPasegeneswereA :32.6% ,C:25.5% ,G:
12.6% andT:29.4% ,respectively.Tilesequencespercentdivergenceswerebetween0—4.0% ,thehighestpercent
divergence(4.0%)wasbetweenerue
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