- 1、本文档共4页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
蛋白酶解及质谱鉴定完整操作流程
仪器:
ABI 4800 MALDI-TOF/TOF 串联质谱仪(ABI)、真空冷冻干燥机、水浴锅、
Mascot 分析软件、移液器、离心管
主要溶液配置:
考染脱色液:25mmol/L NH HCO 、50%乙腈的水溶液
4 3
银染脱色液:15mM K Fe(CN) 、50mM NaS O 的水溶液
3 6 2 3
脱水液 1:50%的乙腈溶液
脱水液 2 :100%的乙腈
吸胀液:25mmol/L NH HCO 的水溶液
4 3
酶解覆盖液:25mM的NH HCO 、10%乙腈的水溶液
4 3
酶解工作液:含 0.02ug/ul 胰蛋白酶的酶解覆盖液
蛋白萃取液:含5% TFA、67%乙腈的水溶液
- 1 -
蛋白点切取:
一、实验操作:
1、将 0.2ml 的枪头前端剪去0.5cm,以增大孔径,
2 、将枪头垂直戳向凝胶上的蛋白点,旋转枪头直至将胶点取下,
3、将取好的胶粒转入装有去离子水的 0.5ml 离心管里,用枪头反复吸打溶
液至枪头内胶粒进入离心管,
4 、吸干去离子水后封盖保存并做好标记。
二、注意事项:
1、离心管最好用进口离心管,以免塑料污染;水最好用去离子水,
2 、取点时带好口罩与手套以及头套,以免皮屑等角蛋白的污染,
3、蛋白鉴定需要的蛋白量越多越好,所以尽可能把某一个点里所有的蛋白
全部取到,不过某些比较大的点就只要取一部分就可以了,
4 、针对特别小的蛋白点,枪头孔径可能会比蛋白点面积大,取点时把该蛋
白点的边上空白部分也一起取一些下来也不要紧,
5、蛋白点的纯度越高越容易鉴定,一般双向电泳的点都是独立的蛋白,纯
度完全满足鉴定的要求,针对有部分交叉的蛋白点,取点时注意不要取混,混
合的蛋白点增加质谱鉴定的难度,降低鉴定成功率,
6、取完的蛋白点可以放在室温下保存 1 周左右,可以放在-20 度或者-80
度保存半年以上,
7、只有胶图上清晰可见的蛋白点,其含量就足够用于质谱鉴定,所以只要
取一次蛋白点就可以了,不需要把几张胶上的蛋白点取了放在一起进行鉴定,
同时注意不要把胶点弄得太碎
8、条件允许的话可以多取一次胶点的重复以做好备份。
- 2 -
蛋白质酶解:
一、考马斯亮兰染色蛋白点的酶解:参考[Katayama H., Nagasu T., Oda Y.,
Improvement of in-gel digestion protocol for peptide mass fingerprinting by
matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, Rapid
Communications in Mass Spectrometry, 15, 1416 - 1421]的方法进行
1、将切取的蛋白胶点转入0.5ml进口离心管中,采用超纯水漂洗两次,
2 、加入考染脱色液,脱色30min,
3、吸出脱色液,加入脱水液1,脱水30min,
4 、吸出脱水液1,加入脱水液2 ,脱水30min,
5、吸出脱水液2 ,加入10ul酶解工作液,吸胀30min,
6、加入20ul酶解覆盖液,37℃水浴酶解过夜,
7 、酶解后上清转移至另一新离心管中,
8、加入50ul蛋白萃取液于剩下的胶中,37℃温浴30min,5000g离心5min,
合并上清,冻干后待做质谱。
二、硝酸银染色蛋白质酶解:
1、将切取的蛋白胶点转入 0.5ml 进口离
文档评论(0)