05.03胃肠道微生态的分子生物学技术的研究进展.pdfVIP

中国畜牧兽医 　2008 年第 35 卷第 3 期 动物营养与饲料科学 ·奥特奇协办 ·5 · 胃肠道微生态的分子生物学技术研究进展 于萍 ,王加启 , 卜登攀 ,贺云霞 ,魏宏阳 ,周凌云 ,刘卉 ( 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 ,动物营养学国家重点实验室 ,北京 100094) 摘要 :哺乳动物胃肠道中的小型生物群被赋予高种群密度 、广泛的多样性及相互作用的复杂性等特性 ,它们在宿主营养 、 生理和免疫等方面起着主要作用 。作者综述了研究动物 胃肠道微生物的现代分子生物学技术的原理及应用 ,并展望随着分 子生物学技术的飞速发展 ,对胃肠道微生物的研究将会更加深入 ,从而为指导实践提供可靠的理论依据 。 关键词 : 胃肠道小型生物群 ;微生物生态学 ;小亚基 r RN A/ rDN A ; 分子技术 中图分类号 :Q933 1 　　　　　文献标识码 :A 　　　　　文章编号 : 167 17236 (2008) 　　细菌是动物胃肠道的优势菌 。正常哺乳动物的 常在种的水平上鉴定生物群的组成 ;指纹图谱技术 胃肠道中栖息着 400 多种细菌 ,每克内容物中数量 可以分析微生物群落结构 ,而斑点杂交技术或荧光 10 11 ( ) 高达 10 ～10 个 Mackie 等 ,1997 ,其中绝大多数 原位杂交技术能够测定特殊分类群的丰度 。一些新 是厌氧细菌 ,这些微生物在宿主动物营养 、生理和免 兴技术 ,像功能基因及其表达以及稳定同位素和生 疫过程中具有深远的影响 。胃肠道微生物生态学研 物标记的联合使用 ,正在发展和优化 , 以用于研究个 ( ) 究涉及现存有机体的研究 丰度和多样性 、活性的 体或群体原位代谢活性 。复杂微生物生态系统的核 ( 研究 通过在体外测定 ,但是理想上应该在体内测定 酸分离序列比较可以用于描述分子特性 , 同时也提 ) 活性 、相互之间的关系以及与宿主的关系的研究 供一个分类体系 ,可以预测 自然进化关系 。作者综 ( ) 协同作用和竞争作用 。在过去 40 年中 ,技术的推 述了目前研究胃肠道生物群应用的分子生物学技术 动使我们对胃肠道微生物生态学的知识有了很大的 并讨论其今后发展方向。 进步 ,主要经历了 3 个过程 : ①厌氧培养技术的发 1 　从培养到分子分析的过渡 展 ; ②利用啮齿动物模型试验确定肠道细菌和宿主 为了得到一个可培养性的评定 ,微生物生态学 之间的关系 ; ③动物模型的建立及无菌动物的应用 家一般将显微镜计数法与总的活菌计数法做比较 。 ( ) 等 Savage 等 ,200 1 。 总的活菌计数法是在非选择性琼脂基础培养基上评 从传统上讲 ,我们主要利用基于培养的技术对 定每克样品中菌落形成单位的数量 。研究结果发现 胃肠道细菌进行了研究 ,该技术在实验室广泛使用 总的活菌计数要比总的显微计数少 ,可能是由于死 且需要了解个体营养需要 。但是可培养微生物仍然 细菌造成的。事实上 ,粪便中的死细菌可能构成了 ( )