芸薹属植物比较基因组学的的研究进展.pdfVIP

植物学通报Chinese Bulletin of Botany 2007, 24 (2): 200207, .专题介绍. 芸薹属植物比较基因组学研究进展 李媛媛, 傅廷栋, 马朝芝* 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室, 武汉 430070 摘要 芸薹属(Brassica)植物是双子叶植物比较基因组学研究的重点对象。经过十几年的研究, 芸薹属植物比较基因组学研 究已取得很大进展。宏观共线性和微观共线性两个层次的研究均发现, 芸薹属植物之间以及芸薹属和拟南芥之间都存在广泛 的共线性, 表明拟南芥信息在芸薹属中具有重要应用价值。芸薹属作物基因组内存在着多个拷贝的共线性区域, 支持二倍体 芸薹属作物起源于多倍体祖先的假设。 关键词 芸薹属, 比较基因组, 拟南芥, 宏观共线性, 微观共线性 李媛媛, 傅廷栋, 马朝芝 (2007). 芸薹属植物比较基因组学研究进展. 植物学通报 24 , 200207 . 比较基因组学(comparative genomics)又称比较遗 BBCC, 2n = 34) 3 个四倍体复合种。种间人工合成的 传学, 是指在不同物种之间利用共同的标记构建图谱或 研究结果表明, 白菜、甘蓝和黑芥为3个基本染色体种, 对不同物种基因组相应部分(或全部)区域进行测序, 比较 它们通过相互杂交和自然加倍而形成了现在的四倍体种, 它们之间的基因数目、相对位置、结构关系等, 以揭 这就是著名的禹氏三角(U, 1935) 。通过对核DNA 含量 示不同物种之间的基因家族成员数目和排列顺序的异 的计算, 推测二倍体芸薹属基因组约为拟南芥基因组 同。一般来讲, 比较基因组学主要包括两个方面: 基于 (125 Mb)的3-5倍, 而四倍体芸薹属基因组则是拟南芥 遗传图谱的宏观共线性和基于物理图谱或测序的微观共 基因组的 10 倍左右( Be n net t a nd S m it h , 19 7 6 ; 线性。目前, 禾本科植物的比较基因组研究最为透彻, Arumuganathan and Earle, 1991) 。 而芸薹属(Brassica)植物则是双子叶植物比较基因组学 研究的重点对象。从20 世纪90 年代至今, 经过十几年 2 芸薹属植物比较遗传图谱 的历程, 芸薹属植物比较基因组学研究已在宏观共线性 和微观共线性两方面都取得了较大进展。 比较遗传作图是利用一个种的基因或者基因的部分片段 或者遗传标记, 通过遗传学的方法在其它的物种中寻找 1 芸薹属植物基因组概况 其同源序列及构建相应的遗传标记图。芸薹属植物比 较遗传图谱研究可对芸薹属植物之间的结构、亲缘关 芸薹属是十字花科(Cruciferae)植物中最重要的一个属, 系及其进化演变提供分子水平的证据; 特别是芸薹属和 包含许多有重要经济价值的油料、蔬菜和饲料作物。 拟南芥的比较遗传作图, 将大大增加芸薹属中可供利用的 从细胞遗传学角度讲, 芸薹属栽培种包括白菜(B. rapa; 遗传标记。近年来, 芸薹属植物之间以及芸薹属植物与 AA , 2n = 20)、甘蓝(B. oleracea; CC, 2n = 18)和黑 拟南芥之间的比较遗传作图研究都取得了一些重要结果。 芥(B. nigra; BB, 2n = 16) 3 个二倍体基本种以及甘蓝 2 . 1 芸薹属植物之间的比较作图 型油菜(B. nap us ; AA CC, 2n = 38) 、芥菜型油菜(B. j uncea; AABB, 2n = 36)和埃塞俄比亚芥(B. carinata; 芸薹属不同种基因组的比较研究首先是在白菜和甘蓝之 收稿日期: 2006-05-26; 接受日期: 2006-08-26 * 通讯作者。E-mail: yuanbeauty@