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用户使用文档(Linux Cluster部分) 操作系统： Linux操作系统使用Redhat Enterpirse Linux AS 4.0, 包含Redhat分发的绝大部分的软件包，用户可以在PC上安装Rehat Linux 9.0或其它linux熟悉操作系统环境。 参考书籍：UNIX编程环境 文本编辑器：用来编译代码的编译器主要有：vim emacs 等。 此部分要求在使用前熟悉。 编译器: 本部分目的在于掌握Intel Compiler的使用。请在此之前熟悉C/Fortran语言。 Intel C/C++编译器接受遵守ANSI C/C++ , ISO C/C++ standards, GNU inline ASM for IA-32 architecture标准的输入。与linux下常用的gcc兼容并支持更大的C语言扩展，包括源文件、命令行参数、目标文件。不支持gcc的inline方式的汇编。 例： 注意，编译与链接都由icc来完成，icc常用命令行参数： -o 输出文件命名 -I include路径 -L lib路径 -l 包含的lib名 -c 仅生成目标文件(*.o),不链接 -On n=0,1,2,3 编译器优化选项，n=0关闭编译器优化，n=3使用最激进的优化 -c99[-] 打开/关闭 c99规范的支持 详细的请参照icc的manpage. Intel Fortran编译器支持F77/90/95标准并与CFV(Compaq Visual Fortran)兼容。 例： 编译与连接同样由ifort来完成，ifort常用命令行参数： -o 输出文件命名 -I include路径 -L lib路径 -l 包含的lib名 -c 仅生成目标文件(*.o),不链接 -On n=0,1,2,3 编译器优化选项，n=0关闭编译器优化，n=3使用最激进的优化 -std90 使用F90标准编译 -std95 使用F 95标准编译 -f77rtl 编译使用F77运行方式的代码（用于解决特殊问题） 核心数学库的使用 本节介绍Intel MKL的使用。Intel MKL数学库针对Intel系列处理器进行了专门的优化，主要包含的库有： 基本线形代数运算(BLAS) 向量与向量、向量与矩阵、矩阵与矩阵的运算 稀疏线形代数运算 快速傅立叶变换(单精度/双精度) LAPACK(求解线形方程组、最小方差、特征值、Sylvester方程等) 向量数学库(VML) 向量统计学库(VSL) 高级离散傅立叶变换 例，计算NxN矩阵相乘，属于基本线性运算，查找MKL手册BLAS章节可以使用Level 3中的 ?gemm 函数进行运算，假定计算双精度浮点则使用dgemm 函数。 C语言中的定义(CBLAS中)： ? void cblas_dgemm(const enum CBLAS_ORDER Order, const enum ，CBLAS_TRANSPOSE TransA, const enum CBLAS_TRANSPOSE TransB, const int M, const int N, const int K, const double alpha, const double *A, const int lda, const double *B, const int ldb, const double beta, double *C, const int ldc); 对应数学表达式: ? c = alpha*op(a)*op(b)+ beta*c, 编写一个程序实现： 文件: mulit.c 编译: icc multi.c -I/opt/intel/mkl/include –L/intel/mkl/lib –lmpi_ipf –o multi MPI程序编译方法: 消息传递接口(MPI)并行程序设计模型程序的编译命令。 例：文件hello.c 编译与连接均使用mpicc,参数与mpicc中定义的编译器相同，这里与icc相同。 mpicc –c hello.c –o hello.o mpicc hello.o –o hello 运行使用mpirun 命令，将运行需要的节点定义在文件中并在-machinfile中制定。 文件: nodelist 运行： $mpirun –machefile nodelist –np 4 ./hello node1: hello worl