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- 2015-07-26 发布于安徽
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PCR快速诊断浅部真菌病的初步探讨
李筱芳 陈辉 崔凡 刘维达
中国南京医学科学院皮肤病研究所 210042
摘要
目的:初步建立和评价应用PCR技术直接从临床标本中检测浅部真菌病病原真菌的方法。
方法:采用蛋白酶K消化法和煮沸法处理临床标本,从中提取致病菌DNA,然后用真菌通用引
物ITSI进行PCR扩增检测,并与直接镜检和培养法作对比。
方法约需8h即可完成从标本处理至结果判读的全过程。
结论:PCR检测具有较好的特异性和准确性,且比培养缩短了近2w的时间,为I临床快速诊断浅
部真菌提供了全新的思路。
关键词:浅部真菌病 聚合酶链反应 诊断
Y
浅部真菌病是皮肤科的常见病和多发病,目前确诊主要依据直接镜检和培养,前者不同实验室
的阳性率差异较大,且不能鉴定菌种:后者敏感性差,耗时。因此,建立一种更优的实验室诊断方
法具有较好的临床应用前景。国内已研究开发了多种感染性病症的基因扩增检验技术,部分已有商
·诮化试剂盒,并被作为扩大的金标准方法之一。我们将这一方法应用于浅部真菌病临床标本的检测,
希单使该病的诊断、治疗方案的制订更为快速、客观和准确。
材料和方法
准菌株由中国医学真菌保藏管理中-tl,提供。
除浅部真菌病的患者。取材前先用75%的乙醇消毒局部,然后刮取病变活动部位的皮屑或甲屑,头
癣则取病发。所得标本分为三部分,一部分用于镜榆,另一部分接种于含氯霉素和放线菌酮的沙氏
培养基,其余部分置于无菌Ep管中备DNA提取。
3临床标本DNA的提取:采用蛋白酶K消化法和煮沸法消化角蛋白并破壁,酚.氯法抽提DNA。
培养为阳性的菌株及参照菌株也用同一方法提取DNA。
3’;5’-TTCGCTGCGTTCTTCATCGA.3’),反应总体积为50ul,含5u110
Tag酶。反应条件:94C
物于含EB的2%琼脂糖凝胶上稳压电泳,紫外灯下观察结果。
裴氏着色真菌(D。。)的DNA,以观察反应的特异性。
引物扩增,可以检测到的最高稀释度即为PCR检测的灵敏度。
7.质量控制:严格无菌操作,样品制备区、反应体系配制区和扩增产物检测区独立,并设置阴
性(以三蒸水替换模板DNA)和阳性对照(红色毛癣菌标准菌株T..)。
8.统计学处理:直接镜检、培养和PCR三种诊断方法有两种或两种以上为阳性,方能视为真阳
性,以此为“金标准”计算各种方法的临床诊断敏感度、i临床诊断特异度、阳性预测值、阴性预测
“金标准”的一致性。
结 果
1
色毛癣菌标准菌株的大小一致。PCR的检出率为41.1%,其中甲部18例,体股部17例,手足部1
阳性。(图1)
圈I真菌ITSI区PCR扩增结果1:ladder;2:人体细胞;3:金黄色葡萄球
菌:4:大肠杆菌;5:阴性对照;6:I例来源于足部镜检为阴性面PCR和培养均为阳制
的标奉;7:临床标本;8:‘j7相对应的临床分离菌株;9、10:一患者于.足皮膨标奉.
1 1:红色毛癣菌标准菌株;12;I例手部湿疹排外真菌感染的标奉。
直接镜检、培养和PCR三种诊断方法有两种或两种以上为阳性(真阳性)有57例,三种诊断方
、临床诊断敏感度、临床诊断特异度、阳性预测值、阴性预测值和准确度见表1-表4。
法的Kappa
表1镜检检测结果分析表
表2培养检测结果分析表
表3 PCR检测结果分析表
表4三种诊断方法评价指标的比较
+P0.05。
1种真菌
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