尿嘧啶自由基阴离子微溶剂化模式%3aU-(H2O)n(n%3d3%2c4%2c5).pdfVIP

·8· 化 学 世 界 2006年 尿嘧啶自由基阴离子的微溶剂化模式：U。《坞O)荐《n=3，4，5) 鲍晓光。顾健德’ 《孛嚣薅学藏上海药软骚究凝，上海201203) 关键词：尿嘧啶自由基阴离子；微溶剂化效应 在核苷酸碱基上俘获电子是因辐射引起DNA 中水分子仍然是形成团簇，与尿嘧啶阴离子的04 和RNA损伤中非常重要的过程之一…。研究发现 形成三个氢键。 微溶剂化效应对予碱基毫予亲合势懿增加是菲常重 要的。另外，实验研究发现微溶剂化碱基的绝热电 子亲合势(EAld)和相应自Ell基阴离子的垂直电离 麓(VDE)随水分子拿数翡增加瑟线性增长瞄j。最 近对尿嘧啶和一到三个水分子复合物的理论研究结 果与实验结果并没有达成很好的一致pj。其中一 个可熊的原因是存在能量更加稳定的鑫由基酲离子 和水分子复合物的构型。以前这方面的理论研究只 考虑了形成第一水化层的情况。我们用密度泛函 (B3LYP)方法在DZP÷+基组下继续舔磕睫蛊盘基 阴离予和三到五个水分子的微溶剂化研究。 1结果与讨论 C U4-24t Scheme1．Theatomic and numberingH-bondlngregion缸 ，“”、≯·≮ uracil． (1)几何构型与能量 2％一。 ‘．U(H：O)。我们得到了比前面研究结果E32更 。．凳．．罩 稳定豹两个构型(能量分别低了1。6稍0．6×4．18 kJ／mol。在这两个构型中，第三个水分子同时与另 外两个通过氢键糨互作用，形成一个水的团簇，氯键 of韬。 1，The twom06tstablestructures Figure optimized 。4…Hwl和04…Hw2翡长度均有所缩短(与Ret3 (％O)。(，I=3，4，5)．color is 中的U2-4a和U2-6a相比)。位于第二水化层的水 for isfor isfor oxygen， carbon，whitehydrogen，red 分子增强了尿嘧啶叁由基飘离子秘第一水化层申的 andblueisfor unitofthebond nitrogen。The lenI醇 水分子闽的氢键。 isinA U(H：O)。我们研究了十三个稳定的尿嘧啶自 u(H：O)。我们又研究了九个尿嘧啶自由基阴 由基阴离子和蹬个水分子复合物的构型，这里仅绘 离子秘五令水分子形成复合物懿构型(这里仅绘出 出最稳定的两个构型(图1)。在最稳定的两个构型 最稳定的两个构型)。在能量最低的U5一la构型中， 增刊 化 学 世 界