基因芯片筛选抗胸腺细胞血清性肾炎大鼠肾组织基因表达差异的初步研究.pdfVIP

维普资讯 理苤壶 Chine—seJournalofPathophysiology 2006，22(10)：1885—1890 · 1885 · [文章编号] 1000-4718(2006J10—1885—06 基因芯片筛选抗胸腺细胞血清性肾炎大鼠肾组织 基因表达差异的初步研究冰 徐 娟， 吴宜琴， 王迎伟 ， 徐静华， 佟建霞 (南京医科大学微生物与免疫学系，江苏 南京210029) [摘 要] 目的：利用基因芯片检查大 鼠系膜增生性 肾炎 ，即抗胸腺细胞血清性 肾炎 (ATSN)模型大鼠发病 40min和5d时肾组织相关基因的表达情况，探讨 ATSN大鼠不同时相肾组织基因表达的差异并作功能分析。方 法：用抗胸腺细胞抗血清 (ATS)复制大鼠ATSN模型 ，抽提发病40min和 5d时肾组织 RNA，分别用逆转录合成荧 光分子掺人的cDNA作探针进行基因芯片杂交。用 Agilent扫描仪扫描，Imagene软件读取数据，最后用Genespring 进行normalize处理和差异表达基因的筛选。差异基因筛选标准为实验组／对照组比值 (ratio)或=2为上调基因． 实验组／对照组 ratio或 =0．5为下调基因。然后选取上调和下调基因登录 GenBank查找其相关功能。结果：在 9234个大鼠基因中(去除质控基因)，ATSN大鼠40min时肾组织上调基因为341个，其中部分为凋亡相关的调控 基因，部分为增生相关基因及一些与信号转导有关的基因；下调基因为392个，其中一些是酶类基因，部分为生长因 子和细胞因子受体基因等，其余大多上调和下调基因功能不详。ATSN发病 5d时，肾组织上调基因是213个，包括 增生相关基因、信号转导相关基因等；下调基因119个，其中部分为酶类和细胞因子相关基因。5d时上调和下调基 因大多功能不清楚。结论：大鼠ATSN发病早期 (40min)，致病相关基因已被激活 (如凋亡和增生相关基因)，其中 相关信号转导分子基因也表达上调，而在ATSN大鼠发病5d时，基因表达谱有所改变，其中涉及的基因多为增生相 关基因和信号转导相关基因。 [关键词] 肾炎 ；基因表达；寡核苷酸序列分析 [中图分类号] R363 [文献标识码] A Exploration ofgenestatusinrenaltissuesofratswithanti—·thymocytese- rum nephritisbygenechip XUJuan，WUYi—qin，WANGYing—wei，XUJing—hua，TONGJian—xia (DepartmentofImmunology，NanjingMedicalUniversity，Nanjing210029，China) 【ABSTRACT] AIM ：Toexploregeneexpressioninrenaltissuesfromratswithmesangialproliferativeglomerulone- phritis(MPGN)，namely，anti—thymocyteserumnephritis(ATSN)，at40minutesand5daysafterinjectionwithrabbit anti—thymocyteserum (ATS)，andtoanalyzethedifferencesofgenespectrumandfunctionsbetweenthetwophasesofAT- SNwithgenechip．METHODS：TheratmodelofATSNwasreproducedbyinjectionofATStotheanimals．40minutesand 5dayslater，thetotalRNA inrenaltissueswasextracted．Further，genechipprobeproducedbyreversetrnascriptionwith