生物芯片图像微阵列偏转角度计算及样点分割算法.pdfVIP

维普资讯 第34卷第 l0期 光电工程 Vo1．34，No．10 2007年 l0月 Opto—ElectronicEngineering Oct，2007 文章编号：1003—501X(2007)10—0006—05 生物芯片图像微阵列偏转角度 计算及样点分割算法 严 伟 一，胡 松 ，吴钦章 ，唐小萍 ，佟军民 ，2 (1．中国科学院光电技术研究所，四川 成都 610209； 2．中国科学院研究生院，北京 100039) 摘要：本文首先介绍了样点分割在生物芯片技术中所处的重要意义，并分析了生物芯片样点偏转角度误差来源以 及构成原因，提出了全自动化的图像微阵列偏转角度计算及样点分割的统一解决方案。算法依据生物芯片样点阵 列空间分布特点，并基于重构原理，提出了环形投影方法和功率谱估计相结合的功率切片方法，并以此建立起样 点阵列的像素位置、偏转角以及功率值的三维分布关系，实现斑点阵列中偏转角度的精确计算。在获得偏转角度 值的条件下，采用定向投影法和功率谱估计方法，计算样点阵列的行列间距；利用行、列间距，在一维灰度和序 列中实现分段搜索，获取光斑中心粗定位；利用轮廓图像投影后出现双次峰的现象，估算样点直径；最后，依据 重心法调整斑点中心，同时采用邻域搜索算法调整斑点直径，最终实现生物芯片扫描图像的精确定位和分割。 关键词：生物芯片；功率切片；偏转角度；图像分割 中图分类号：TN911．73 文献标志码：A Computationfordeflectionangleofmicroarraysignal andimagesegmentationofbiochip YANWei，-，HUSong，WUQin．zhang，TANGXiao-ping，ToNGJun-min， (1．TheInstituteofOpticsandElectronics，theChineseAcademyofSciences，Chengdu610209，China； 2．GraduateSchooloftheChineseAcademyofSciences，Bejiing100039，China) Abstract：ForSCalaofbiochip，thereasonsofthedeflectionangleerrorareanalyzed．Then automatedmethod for calculatingdeflectionna gleofmicroarraysignalandimagesegmentationisproposed．Accordingtohtespotsdistributing characteristicsnadreconstructionhteory,powerspectrum slicetechniqueispresented，bywhichhte3-D distributionof spacedomain，deflectionanglena dpowerdomainisconstructed．Sothedeflectionnagleofmicroarraycanbeprecisely calculated．Comb