一、PubMed数据库简介课件.ppt

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一、PubMed数据库简介 PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统。 PubMed的网址:/pubmed 特点:收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备,可少部分获取原文。 二、通过PubMed可检索 到如下的信息 MEDLINE PreMedline 出版商提供的书目信息 NCBI其它数据库的相关记录 MEDLINE MEDLINE:是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最大的生物医学数据库,收录1966年以来70多个国家近4300种生物医学期刊的书目信息和著者文摘,每周更新。每条记录均带有[PubMed--Indexed for MEDLINE]标志。 出版商提供的书目信息:出版商提供的是整本期刊的信息,若有部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存,在记录中做[PubMed--as supplied by publisher]的标记。 其它库 NCBI其它数据库的相关记录:PubMed建立了与NCBI其他数据库之间联系。它们是双向网络互连的关系(见下页图)。 三、PubMed页面的结构 登录 PubMed主页 /entrez/query.fcgi /PubMed/ PubMed页面的结构 NCBI数据库 Nucleotide:DNA序列数据库 Protein:蛋白质序列数据库 Genome:基因组序列数据库 Structure:分子结构模型数据库 Popset:种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy:微生物类别数据库 OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库。 PubMed辅助检索工具 Limits (限制功能) Preview/Index(预览/索引) History(检索史) Clipboard(剪贴板或文件夹) Details(明细栏) 四、PubMed的基本检索功能 词语检索及自动词语匹配 作者姓名检索 杂志名称检索 截词检索 短语检索 逻辑运算符检索 四、PubMed的基本检索功能(一) 词语检索及自动词语匹配 在检索框中键入一到多个检索词,按“GO”键,即显示检索结果。 “clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容,然后开始一个新的查询。 四、PubMed的基本检索功能(一) 自动词语匹配 PubMed能自动利用它的“自动词语匹配”功能将重要的词语结合在一起,并将不规范的词语转换成规范的用词。 如:输入vitamin c common cold,系统会将自动转换成(“ascorbic acid”[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]) AND (“common cold”[MeSH Terms] OR common cold [Text Word])进行检索。这种处理能使检索结果更精确和全面。 四、PubMed的基本检索功能(二) 作者姓名检索 在检索框内按照姓+名缩写(不用标点)的格式键入作者姓名,如Smith ja,系统会自动在作者字段内进行检索。 如果想进行更精确的检索,可以用双引号将作者名引起来,再加[au],如“smith j”[au] 四、PubMed的基本检索功能(三) 杂志名检索 在检索框中键入杂志全名molecular biology of the cell 也可以直接键入Medline的期刊标准缩写形式,如:mol boil cell, 键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码)进行检索,如1059-1524。 Cell transplantation [ta] 四、PubMed的基本检索功能(四) 截词检索 可利用系统的截词功能获取更多的相关文献,这与Medline光盘中截词检索的用法是相同的:截词符“*”可代表多个字符,将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索;如:bacter*,可以检出bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage等词。 PubMed一次最多可以检索出150个词形变异词。如staph*,可以产生150个起作用,可以采取加长词根的方法进行检索。 四、PubMed的基本检索功能(五) 短语检索 PubMed首先将键入的检索词(词组)视为合理的短语在短语索引中进行查找。如:poison ivy,PubMed将其视为词组进行查找。当PubMed没有找到该词组时,系统将自动把两个词分开进行检索; 如果不希望系统将两词分开,则需要用“”把检索词括起来,即强迫PubMed进行词组检索。如“single cell”。 当用双引号括起词语时,PubMed将不执行自动词语匹配功能。 四、PubMed的基本检索功能(六) 逻辑运算符检索 在检索框中输入逻辑

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