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第三章PCR.ppt

PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 PCR的基本原理 PCR反应条件 PCR过程 PCR的特点 * 1Kb以内的DNA片段,延伸时间1min(足够); 《基础生物化学实验》(第二版) 生物化学实验 聚合酶链式反应 (Polymerase Chain Reaction,PCR) 一、PCR技术的原理 是在体外模拟体内DNA复制过程快速扩增DNA的方法。 以待扩增的DNA分子为模板,以1对与模板互补的寡核苷酸片段为引物,以dNTPs为底物,在DNA聚合酶作用下,经过高温变性、低温退火和适温延伸三个阶段的循环,依半保留复制机沿模板合成2条新的DNA分子。重复这一过程,可使模板DNA以几何级扩增(2n)。 实际往往可以将微量目的DNA片段扩增一百万倍以上。 1 2 3 4 5 22 55 72 94 时间(min) 温度 (℃) 适温延伸 3 高温变性 1 低温退火 2 重复1~3步 25~30轮 目的DNA片段 扩增100万倍以上 DNA双螺旋 DNA单链 与引物复性 子链延伸 DNA加倍 DNA变性 形成2条单链 模板DNA 95℃ 95℃ 50℃ 引物1 引物2 DNA引物 50℃ 引物1 引物2 DNA引物 72℃ Taq酶 Taq酶 72℃ 第1轮结束 95℃ 第2轮开始 95℃ 50℃ 72℃ Taq Taq Taq Taq 72℃ 第2轮结束 模板DNA 第1轮扩增 第2轮扩增 第3轮扩增 第4轮扩增 第5轮扩增 第6轮扩增 PCR的反应体系 标准的PCR反应体系( 100ul ) 模板DNA 0.1~2ug 引物 10~100pmol 4种dNTP混合物 各200umol/L 10×扩增缓冲液 10ul Mg2+ 1.5mmol/L Taq DNA聚合酶 2.5u 加蒸馏水至 100ul 可根据实际需要进行调整 PCR的反应条件 PCR的反应条件 ※ 温度 ※ 时间 ※ 循环次数 变性 93-97?C 延伸 72?C 退火 40-60?C PCR的特点 灵敏度高 皮克(pg=10-12)量级扩增到微克(ug=10-6)水平 能从100万个细胞中检出一个靶细胞 病毒检测的灵敏度可达3个PFU 细菌检测的最小检出率为3个细菌 简便、快速 一次性加好反应液,约2小时完成扩增 扩增产物一般用电泳分析 对标本的纯度要求低 绝大多数组织的粗提DNA 引物设计: (1)序列应位于高度保守区,与非扩增区无同源序列。 (2)引物长度以15-40 bp为宜。 (3)碱基尽可能随机分布,G+C尽量不超过60%。 (4)引物内部避免形成二级结构;两引物间避免有互补序列。 (5)引物3’端为关键碱基;5’端无严格限制。 (6)引物5’ 添加酶切位点。 PCR技术的主要用途 目的基因的克隆 基因的体外突变 DNA和RNA的微量分析 DNA序列测定 基因突变分析 二、操作 1.PCR的反应体系的配制 2×Mixture 12.5 μL H2O 9.5 μL 模板DNA: 1 μL P1(20μM) 1 μL P2(20μM) 1 μL 25μL 2.反应体系混匀。 二、操作 3. PCR程序 (1)94℃ 5 min (2)94℃ 30s (3)60℃ 30 s (4)72℃ 30 s (2)-(4)步 30个循环 (5)72℃ 5 min 二、操作 4. 1.5%琼脂糖凝胶电泳 (1)上样量:5μl PCR产物 (2)分子量标准:DL2000 (3) V=120, 30min 5. 在凝胶成像系统中观察并记录实验结果 三、结果 M 阴 1 2 3 4 5

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