异源四倍体棉花分子遗传图谱构建和纤维品质QTL定位.pdf

摘 要 遗传基础狭窄已经成为目前限制陆地棉遗传改良的主要因素。在陆地棉和海岛棉 间进行优良基因的高效转移渗透对二者的遗传改良具有极为重要的现实意义，而限制 这一过程的主要因素是连锁累赘。分子遗传图谱无论在基因定位和辅助选择以及重要 基因的图位克隆方面,还是在研究棉花的基因组组织结构和起源进化方面都具有重要 的理论和应用价值。本研究以海陆杂交群体为基础，构建了四倍体棉花的分子遗传图 谱并对纤维品质等性状进行了QTL 标记定位研究。研究的主要结果如下： 1、从2701 对SSR 引物中筛选出753 对多态性引物，选取其中335 对引物对群体进 行分子检测，获得372 个标记位点。本研究最终用于图谱构建的SSR 标记位点数 为209 个，其中包含121 对锚定引物。对209 个标记位点的标记基因型分析表明 该群体分离正常，符合遗传图谱构建要求。 2 、采用连锁测验标准LOD 值为3.5 ，最大连锁距离设为50cM，将209 个多态性标 记位点定位到 29 个连锁群上，标记间平均遗传距离为 9.6cM ，连锁图谱覆盖 2010.7cM ，约占棉花基因组的40.21% 。所获得的29 个连锁群可以定位到23 条 染色体和1 条未知连锁群上，分别为A1(chr.1) 、D1(chr.15) 、A2(chr.2) 、 D2(chr.4) 、 A3(chr.3) 、 D3(chr.7) 、 A4(chr.4) 、 D4(chr.22) 、A5(chr.5) 、 D5(chr.19) 、 D6(chr.25) 、 A7(chr.7) 、 D7(chr.16) 、 A8(chr.8) 、 D8(chr.24) 、 A9(chr.9) 、 A10(chr.10) 、 D10(chr.20) 、 A11(chr.11) 、 D11(chr.21) 、 A12(chr.12) 、 A13(chr.13) 、 D13(chr.18) 和Unknown 。 3、对209 个SSR 标记位点进行卡方检验，其中有30 个（14.30%）表现偏分离，全 部定位到染色体或连锁群上。偏分离标记位点的分布在染色体或连锁群以及A 、 D 染色体亚组间很不均匀。分布在A 染色体亚组（18.34%）上的偏分离位点显著 多于D 染色体亚组（10.20%）。在染色体9 上发现明显的偏分离标记聚集现象。 4 、以新构建的分子遗传图谱为基础，利用BC 和BC S 群体表型数据，通过复合区 1 1 1 间作图法对四倍体棉花纤维品质性状进行QTL 定位分析，检测到13 个与纤维品 质性状相关的QTL ，分布于7 条染色体上。纤维长度相关QTL 4 个、整齐度2 个、伸长率 1 个、马克隆值 3 个、比强度 3 个，分别可以解释表型变异的 9.55%~19.36%、10.99%~12.93%、13.84%、9.63%~14.37%、15.47%~18.29%。 关键词：棉花；SSR；遗传图谱；纤维品质；QTL ；复合区间作图 Construction of Genetic Linkage Map and QTL Mapping of Fiber Quality in Allotetraploid Cotton Author: Yang Xinlei Major: Crop Genetics and Breeding Supervisor: Prof. Ma Zhiying Prof. Wang Xingfen Abstract Intraspecific