大鼠肝再生与肝瘤发生的基因转录谱相关性及其意义研究.pdfVIP

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大鼠肝再生与肝瘤发生的基因转录谱相关性及其意义研究.pdf

I㈣9㈥607删56Y1 摘要 肝癌是由于细胞的无限增殖引起的恶性肿瘤疾病,其发生的过程包括无明显损 伤、纤维化、硬化、增生结节、肝恶性肿瘤等阶段。为了解肝肿瘤发生的基因组学基 Genome230 础,本文用Rat 2.0芯片检测了大鼠肝肿瘤的5、8、12、16和18周时肝 组织的基因表达谱。为进一步分析肝癌发生机制,本文把上述基因表达谱同2/3肝切 达谱做了深入的比较分析,并以JNK、ERKl/2信号通路为例,对它们在上述二者中 调控增殖和凋亡的作用异同用系统生物学等方法做出预示。 RatGenome2302.0芯片检测大鼠肝肿瘤不同时间点肝组织的基因表达谱结果显 示909个基因与大鼠肝肿瘤发生相关。用生物信息学和系统生物学等方法分析肝脏细 胞基因表达谱与肝肿瘤发生的相关性表明,肝肿瘤发生涉及刺激、炎症、免疫等反应、 信号转导、基因转录、物质运输、糖类、脂类、蛋白质、氨基酸、核酸、有机酸、毒 物等代谢、氧化还原反应、内环境稳定、细胞增殖、生长、分化、发育、建成、凋亡、 迁移、粘附等23种生理活动变化。用上述基因表达谱与肝再生恢复不同时间点的肝 组织基因表达谱分析比较发现,肝肿瘤中药物和有机毒物代谢、脂类、类固醇和化学 类物质等内环境稳态维持和细胞粘附、迁移可能强于肝再生;肝肿瘤中的炎症、免疫 等防御性反应和细胞凋亡活动受到抑制,而肝再生前期和中期的炎症、免疫反应和细 胞凋亡得到促进;血管发生和细胞增殖、生长在两者中都发挥重要作用,但肝再生中 血管发生和细胞增殖的可控性却强于肝肿瘤;肝肿瘤和肝再生中的多种物质代谢活动 减弱,但肝肿瘤发生中物质和能量的来源可能是糖、氨基酸及其衍生物代谢,而再生 肝主要依赖脂类代谢。用两者基因表达谱预示JNK、ERKl/2信号通路的生理活动表 明,JNK信号通路在肝再生启动期和前中期以细胞凋亡为主,中后期细胞增殖和细胞 凋亡均有发生,在肝癌发生的诱导间歇期以细胞增殖为主,持续诱导中期增殖和细胞 凋亡均有发生,ERKl/2信号通路在肝再生的前中期促进细胞增殖,在肝癌的持续诱 导中期诱导细胞增殖。 总之,大鼠肝肿瘤发生与909个基因和23种生理活动密切相关,与肝再生的发 生相比,二者有着广泛的相似和不同,在调控细胞增殖、凋亡的JNK、ERKl/2信号 人鼠肝再生与肝肿瘤发生的基冈转录谱相关性及其意义研究 通路中,二者的生理活动也有着较大相似和不同之处。 关键词:肝肿瘤,肝再生,基因表达谱, JNK,ERKl/2 Ⅱ ABSTRACT characterized cell and malignantproliferationgrowth,and Hepaticcancer(HC)isgenerally by theocGurrenogofHCcover烈tthe of of cirrhosis, liver,liverfibrosis,liver stagesnon·specificinjury rat thecorrelationbetween of nodulesandlivercarcinoma.To dysplasia explore geneexpressionprofile DENA-inducedHCwas liversandtheOCCUrrengAeoflivercanc

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