油桐β-酮脂酰-ACP合酶Ⅲ基因克隆及序列分析(原版论文).pdfVIP

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江西农业大学学报 2013,35(4):775—781 http://xuebao.jxau.edu.cn ActaAgriculturaeUniversitatisJiangxiensis E—mail:ndxb7775@ sina.COB 油桐 13一酮脂酰 一ACP合酶Ⅲ基因 克隆及序列分析 严方方 ,谭晓风 ,龙洪旭 (1.中南林业科技大学 经济林培育与保护教育部重点实验室 ,湖南 长 410004;2.中南林业科技大学 经济林育种与 栽培国家林业局重点实验室,湖南 长沙 410004) 摘要:B一酮脂酰 一ACP合酶——KAS是脂肪酸合成中的一种缩合酶,主要是在缩合反应中起作用。研究以近 成熟的油桐种子为材料 ,根据GenBank中蓖麻等已知的B一酮脂酰一ACP合酶基因KASIII的序列设计简并引 物,利用PCR、RACE等技术克隆得到了油桐KASⅢ基因的全长eDNA序列。该基因序列全长 1901bp,开放阅 读框为 1209bp,编码403个氨基酸,通过与其他物种的KASⅢ氨基酸序列 比对,油桐 KASⅢ基因与麻疯树的 同源性最高 ,达9o%。软件预测表明,KASⅢ蛋白等电点为5.78,存在跨膜结构域,整个蛋白质基本上是表现 出亲水性的。将该基因命名为 一kasHI。 关键词 :油桐;KASm;基因克隆;序列分析;结构预测 中图分类号:$794.302 文献标志码 :A 文章编号:1000—2286(2013)04—0775—07 CloningandSequenceAnalysisofFull—lengthcDNA Encoding Beta-·ketoacyl-A·CPSynthasem from Verniciafordii YAN Fang.fang ,TAN Xiao—feng, ,LONG Hong—XU , (1.KeyLaboratoryofCultivationandProtectionforNon—woodForestTrees,CentralSouthUniversityof Forestry andTechnology,MinistryofEducation,Changsha410004 China;2.TheKeyLabofNon—WoodForest ProductofState Forestry Administration,CentralSouth University ofForestry and Technology,Changsha 410004,China) Abstract:Beta—ketoacyl—ACPsynthaseisafattyacidsynthesiSunderthecondensationeffectofenzyme, playsaroleinthecondensationreaction.TheprimerwasdesignedaccordingtotheKASIlIsequencesrecorded ingenbank.Full-LengthcDNA ofKASⅢ wasobtainedbycloningitwithPeR,RACE,etc.mehtods.Itwas l901bpinlengthandcontaineda1209bpORF (openreadingflame)encodingapeptideof403amino acids.aminoacidsequencealignmentwithotherspeciesshowedthattheKASⅢofVerniciafordiidisplayedthe highestsimilarity(90%)toJatrophacurca$.ThepredictedisoelectricpointoftheKASm was5.78.Amem— branespanningdomainwaspresentinthegene.Theproteinshowshydrophilicbasically. Keywords:Verniciafordii;KASII;genecloning;sequenceanalysis;structureprediction 油桐(Verniciafo

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