新进腹足目dn条形码与系统发育研究.pdf

新进腹足目DNA条形码与系统发育研究 新进腹足目DNA条形码与系统发育研究 摘要 新进腹足目是腹足类中种类最为丰富的类群，大约包含了60％的现存腹足类 种类。该目贝类大部分生活在海中，具有较高的生态价值和经济价值。但是，针 对这一类群的生物多样性及系统发生关系的研究却很少，其分类地位及系统发生 关系仍然不明确。随着近年来全球气候变化及环境污染问题的加剧，新进腹足目 贝类的生存环境受到了极大的威胁。人类对认识生物多样性、保护生物多样性的 需求日益迫切，而物种鉴定是对生物多样性保护和持续利用的基础。DNA条形 码技术作为一种快速而准确进行物种鉴定的技术受到人们广泛的关注。在本研究 我们首先验证了DNA条形码技术的可行性，然后利用该技术对新进腹足目贝类 进行了初步的系统发生关系的研究。具体研究结果如下： 1．对采自中国沿海新进腹足目贝类50种共137个个体的线粒体COI序列进行 PCR扩增及测序，共得到其中45种110条COI序列，扩增个体成功率为80．3％。 对所得到的CoI序列进行分析，发现种内遗传距离在O．00％到3．89％之间，平 均为O．44％；属内种间遗传距离在7．01％到26．95％之间，平均为13．96％；科 内种问遗传距离在8．23％到31．19％之间，平均为22．27％。可以看出，种间遗传 距离远远大于种内的遗传距离，存在条形码间隙。结果证明，基于COI基因的 DNA条形码技术可以有效鉴定所研究的种类。 2．测定了新进腹足目26种贝类的16SrRNA基因序列，并从GenBank上下载 了部分种类的COI和16SrI矾A基因序列，连同上一节研究中得到的COI序列 对新进腹足目贝类进行初步的系统发生关系研究。在邻接树及贝叶斯两种系统树 上，所有种类均形成单系群，且具有较高的支持度。在基于COI序列构建的系 统树中，部分属及总科没有形成单系，其系统树拓扑结构明显比基于16S序列构 建的系统树效果要差。在基于】6S序列构建的系统树中，六个总科及大部分属都 表现出较近的亲缘关系。利用线粒体基因序列构建的系统发生树得出的新进腹足 目系统生发关系，与传统的形态分析结果基本一致。 V1l 新进腹足目嬲A条形码与系统发育研究 关键词：D姒条彩码、∞l基因、系统发生、耨进腹避嚣 Vlll 新进菔足嗣洲A条形码与系统发育研究 Molecular of DNA and Barcoding Phylogeny C建e飘og纛st鞠p◇d纛 Abstracl about60％of and赫cludea liVing species Caenogas昀podscompr主se gas臼Dpod nuInberof and marine矗Hnilies．11le 1arge conlmercially ecologically importaIlt betweenmefamiliesa11d remain u11resolVed relationsllips supe加iliesla唱ely of is畦H．eatenedbecauseoftlle p姆logenetieally．TheliVingCaenogaStropods pollution 鑫靛d