《取代基对腺嘌呤与胸腺嘧啶氢键复合物体系结合能的影响.》.pdfVIP

V0l_35 高等 学校 化 学 学报 No．1 2014年 1月 CHEMICALJOURNALOFCHINESEUNIVERSITIES l54～l60 取代基对腺嘌呤与胸腺嘧啶氢键复合物 体系结合能的影响 刘 朋，李书实，王长生 (辽宁师范大学化学化工学院，大连 116029) 摘要 优化得到了l7个取代胸腺嘧啶与腺嘌呤形成的氢键复合物的结构 ，并计算了这些复合物的结合能， 探讨了胸腺嘧啶上不同取代基对结合能的影响．结果表明，CF取代的胸腺嘧啶与腺嘌呤间的结合能大于胸 腺嘧啶与腺嘌呤间的结合能，这可能是屈氟尿苷具有阻止病毒及肿瘤扩散功能的原因所在．SOH，CN和 NO：取代的胸腺嘧啶与腺嘌呤间具有更大的结合能，表明这 3个基团取代的胸腺嘧啶也可能具有潜在的抗 肿瘤作用．分子中原子理论与 自然键轨道分析表明，在所有体系中，氢键 N—H…N最强，N—H…0===C次 之，c—H…0一 C最弱 ，轨道作用在氢键作用中占有重要地位． 关键词 屈氟尿苷；胸腺嘧啶；腺嘌呤；取代基效应 ；结合能；氢键 中图分类号 0641 文献标志码 A 病毒性感染疾病与肿瘤类疾病均依靠核酸复制来增值扩散…，故可以通过干扰病毒及肿瘤的核酸 合成来达到抗病毒及抗肿瘤的目的，而某些碱基类似物就可以发挥这样的作用 J．碱基类似物与正常 碱基十分相似，足以使其被细胞摄取，转化成核苷三磷酸，并在复制中“骗过”DNA聚合酶，将 自己整 合插入DNA中．一旦碱基类似物成功进人DNA中，会因其与正常碱基在结构上存在差异，导致复制 与转录过程错误频发，从而有效地阻止病毒及肿瘤的扩散 J． 在DNA合成过程中，新加入的碱基核苷酸与模板 DNA链上相应的碱基通过氢键作用正确配对， 因此研究生物体系的氢键作用有重要意义 ，并可对开发新型治疗病毒与癌症疾病的药物提供指 导．Mohajeri等 研究了l5个核酸碱基对体系的N—H…N型和N—H…O型氢键作用强度的影响． Uchimam等 研究了取代基对A．u和c—G中氢键强度的影响．Li等 提出了一种预测多重氢键体 系中单个氢键强度的方法，并将其用于计算腺嘌呤．胸腺嘧啶和鸟嘌呤一胞嘧啶碱基对中单个氢键的强 度．Hobza等 对Watson．Crick构型结构进行了研究，并着重研究了碱基对中氢键强度、形成氢键原子 间距离和电子相关性等．Dannenberg等 ¨。。利用密度泛函理论和分子轨道理论研究了A—T和G—C两组 碱基对中氢键的协同效应．Garza等 研究了基组重叠误差校正对氢键能量的影响．Li等 采用二阶 微扰理论 MP2方法研究了尿嘧啶与胸腺嘧啶的结合位点，并发现结合能可简单加和．Gadre等 利用 分子的静电势图像研究了DNA碱基对间氢键弱相互作用中的互补 “锁钥”模式．Liu等 采用密度泛 函理论B3LYP方法和二阶微扰理论 MP2方法，研究了不同取代基取代 1一甲基尿嘧啶中的氢原子对 1一甲基尿嘧啶与N一甲基乙酰胺形成的氢键复合物中氢键强度的影响和氢键的协同性．Nibbering等 采用量子计算化学及光谱学方法研究了A．T碱基对复合物在溶剂中的N—H伸缩振动．Pati等 采用 密度泛函理论对核糖核酸苷及其类似物的结构、能量及光学性质进行了详细的研究．上述研究加深了 人们对核酸碱基间相互作用的认识． 屈氟尿苷是一种抗病毒及抗肿瘤药物 J，其结构 (Scheme1)与胸腺嘧啶脱氧核苷相似，可将其视 为c 取代胸腺嘧啶上的甲基得到的．屈氟尿苷在体内被细胞和病毒胸腺嘧啶核苷激酶磷酸化，以所 收稿 日期：2013-07-25． 基金项 目：国家 自然科学基金(批准号21133005)、教育部高等学校博士点基金 (批准号：20102136110001)、辽宁省优 秀人才基金(批准号：LR2012037)和大连市领军人才项 目资助． 联系人简介：王长生，男 ，博士，教授，博士生导师，主要从事理论与计算化学研究．E-mail：chwangcs@lnnu．edu．cn 刘 朋等 ：取代基对腺嘌呤与胸腺嘧啶氢键复合物体系结合能的影响