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芹菜黄酮合成酶Ⅰ基因的克隆与序列分析.pdf
江苏农业学报 (JiangsuJ.ofAgr.Sci.),2014,30(4):855~862
http://wWW.JSnYXb.COrll 855
陈逸云,王 枫,徐志胜,等.芹菜黄酮合成酶I基因的克隆与序列分析[J].江苏农业学报,2014,30(4):855—862
doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2014.04.026
芹菜黄酮合成酶 I基因的克隆与序列分析
陈逸云, 王 枫 , 徐志胜, 谭国飞, 李梦瑶, 熊爱生
(南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,园艺学院,江
苏 南京 210095)
摘要: 选用3个芹菜材料六合黄心芹、津南实芹和美国西芹 ,分别从中克隆了合成黄酮类化合物的关键酶基
因——芹菜黄酮合成酶 I基因(AgFS,)。该基因全长均为 1616bp,含有 359bp的内含子 I和 190bp的内含子 II。
芹菜AgFS,基因编码 355个氨基酸,属于20G—Fell—Oxy超级家族。序列分析结果显示,3种芹菜中AgFS,基因在
核苷酸水平上有5个碱基的差异 ,编码的氨基酸有5个位点的差异。芹菜黄酮合成酶 I(AgFS,)与其他来源植物
的FSI氨基酸多重序列比对分析结果表明,该酶具有高度保守性。对AgFS,进行进化树分析 ,氨基酸序列的疏水
性/亲水性分析,三级结构预测与分析,结果显示AgFSI与同属于伞形科的胡萝 b和孜然芹的FSI进化关系最近,
AgFSI属于疏水性蛋白质,3种芹菜AgFSI的空间结构相似。
关键词 : 芹菜;黄酮合成酶 I;基因克隆;序列分析
中图分类号: s636.3 文献标识码 :A 文章编号: 1000-4440(2014)04-0855-08
CloningandsequenceanalysisofflavonesynthaseIgeneinApium graveo—
lens
CHEN Yi—yun, WANG Feng, XU Zhi—sheng, TAN Guo—fei, LIMeng—yao, XIONG Ai—sheng
(StateKeyLaboratoryofCropGeneticsandGermplasmEnhancement,Min~tryofAgriculture/KeyLaboratoryofBiologyandGermplasmEnhancementof
HorticulturalCropsinEastChina,CollegeofHorticulture,NanjingAgriculturalUniversity,Na ng210095,China)
Abstract: TheflavonesynthaseIgene(AgFS,),thekeygeneforflavonoidssynthesis,wasclonedfromApium
graveolenscultivarsLiuhehuangxinqin,JinnanshiqinandMeiguoxiqin,respectively.ThelengthofAgFS,genewas1616
bp.containing359-bpintronIand190-bpintronⅡ.TheAgFS,geneencodes355aminoacids.belongingtothe20G—
FeIIOxysuperfamily.Thereweredifferencesin5nucleotidesitesand5aminoacidsitesamongthethreecuhivarsofA口—
—
lzmgraveolens.MuhiplesequencealignmentofAgFSIswithFSIsrfom otherplantsshowedthatFSISwerehighlyeonser—
vative.PhylogenetictreerevealedtheAgFSIshadtheclosestrelationshiptoDaucuscarotaandCuminum cyminum
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