黄瓜果实黑刺基因定位及候选基因多样性研究.pdfVIP

第 33卷第 4期 上 海 交 通 大 学 学报 (农 业 科 学版) VolJ33NO．4 2015年 8月 J()URNAL0FSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY (AGRlCULTURALSCIENCE) Aug．20l5 文章编号 ：1671—9964(2015 DOI：10．3969／J．ISSN．1671-9964．2015．04．002 黄瓜果实黑刺基因定位及候选基因多样性研究 彭佳林，聂京涛，曲关玲 ，潘俊松 ，何欢乐，蔡 润 (上海交通大学 农业与生物学院，上海 200240) 摘 要 ：果刺颜色影响黄瓜 (CucumissativusI．)商品品质，是外观品质育种的重要性状之一。利 用黄瓜黑刺 自交系$52，黑刺野生种 hardwickii以及 3个 白刺材料 S1003、wI1983G和 397为试 材，分别构建BC 或F2遗传群体，对黄瓜黑刺性状 (blackspine，B)进行遗传分析与基因定位，并 使用 14个不同遗传背景的黑刺或白刺材料用于B候选基因Csa4G003095序列多样性研究。结果 表明，$52、hardwickii中果实黑刺由显性单基因控制，利用 3个群体均将 B定位于第4染色体的短 臂上，最近两侧翼标记(SSRB一130和 SSR 107)与B的遗传距离分别为 2．O1cM 和 0．78cM。序 列分析发现，4个黑刺黄瓜材料的Csa4G003095预测编码的氨基酸序列没有差异，但 10个白刺材 料在该基 因编码区的变异很大，引起其编码蛋 白的一小段或大段氨基酸缺失，功能缺失造成 了刺色 变异，验证 了Csa4G003095即为黄瓜黑刺基 因B。同时，B基 因侧翼标记 InDelB0l、SSRB一99、 SSRB-130可用于黑刺辅助选择育种，准确率在 97．9 以上。 关键词 ：黄瓜 ；黑色果刺 ；基 因定位 ；标记辅助选择 中图分类号：$642．2 文献标识码 ：A GeneMappingandCandidateGeneDiversityofBlackSpine onFruitinCucumber(CucumissativusL。) PENGJia—lin，NIEJing～tao，QUMei—ling，PAN Jun—song HEHuan—le，CAIRun (SchoolofAgricultureandBiology，ShanghaiJiaoTongUniversity，Shanghai200240，China) Abstract：Spinecolorhasimportantinfluenceoncucumber’Scommercialvalue．ItiSoneoftheimportant fruitexteriorqualitytraitsofcucumber．In thisstudy，cucumberinbred lines$52，llardwickii(C．sativus var．hardzvickii)withblackspineonfruitandS1003，W I1983G，397withwhitespinewereusedtobuild3 BC1／F2populationsforgeneticanalysisandmappingofblack spinegene．Fourteen differentgenetic cucumbermaterialswith differentspinecolorwereanalyzedfordiversityofcandidategeneCsa4G003095． Geneticanalysisshowedthatasingledominantnucleargene，B (black spine)，determinestheblackspine traitinboth$52andhardwickii．Bulkedsegregationanalysis(BSA)wasperformedinthe3populations， BC】[($52×S1003)×81003