thrsp基因’调控区多态性对猪主要产肉性状遗传效应分析.pdf

AnhuiAgriculturalUniversity MasterDegreeDissertation TheGeneticEffectsofPolymorphismsin5’RegulatoryRegionof THRSPGeneonMainMeatProductionTraitsinPigs Postgraduatecandidate:Gong-WeiChen Supervisor:Prof.Hong-QuanChen Specialty:AnimalGenetics,BreedingandReproduction ResearchField:AnimalMolecularGeneticsandBreeding SchoolofAnimalScienceandTechnology, AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei,230036 Hefei,Anhui,P.R.China 万方数据 June, 万方数据 本论文受以下项目资助 国家自然科学基金项目（3117218 ）， 安徽省科技攻关（1401032 7，12010302052）资助。 Thispaperissupportedby： NaturalScienceFoundationofChina （3117218 ） ScientificandtechnologicalkeyprojectsofAnhuiProvince （1401032 7，12010302052） 万方数据 摘 要 猪的产肉性状包括日增重、膘厚和眼肌面积等，影响产肉性状的基因众多而复杂， 其中与脂肪沉积相关的基因则是通过调控胴体脂肪的生成与沉积作用直接或间接地 影响产肉性状。THRSP是甲状腺素受体调控激活的转录因子，THRSP基因主要在脂 肪组织中表达，是调控脂肪沉积的主效基因，本研究旨在探索THRSP基因的多态性 对猪产肉性状的遗传效应。 试验选择长白、大白、红杜洛克和白杜洛克种猪924头作为供试猪，测定的产肉 性状包括日增重（ADG）、平均背膘厚（ABF）、眼肌面积（EMA）、肉脂率（ABF/EMA× 100，MFR）。所有供试猪均按照场方常规的饲养管理进行。采集供试猪耳组织提取DNA， 通过测序方法检测THRSP基因5’调控区的SNPs，计算基因频率，利用固定效应模型 分析各基因型对性状的效应以及贡献率，估计性状基于SNP位点的遗传力，评估THRSP 基因多态性与猪产肉性状之间的关联性。结果表明： 目的片段共存在5个SNP位点，分别为C-459T、T-400C、G-376A、G-98A和A-95T， 分别位于THRSP基因CDS起点的上游-459bp, -400bp, -376bp, -98bp和-95bp位置。 T-400C/G-376A位点组合具有较高的固定效应，其中400TT376GG基因型对ADG 2 （-10.6938 g）和EMA （-2.9184 cm ）具有负效应，对MFR （2.2895）具有正效应。 400TT376GG基因型对眼肌面积 （-8.80%）和肉脂率 （7.49%）的贡献最大 （P0.01）， 其他基于单个位点的基因型均偏小（P0.05）。在5个