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动态性状基因定理论框架的初步构建
摘 要
把表型值随着时间(生命时期,年龄,胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态,
生产水平,代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估
计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的
Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程
的作用,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。
以F:遗传设计群体为例,论述了动态性状基因定位分析的基本原理,推导了QTL
效应大小和位置的极大似然法估计过程,采用MonteCarlo方法模拟产生标记基因型和
个体表型值,设置抽样群体大小、测定日密度和QTL遗传力三个因素各三个水平,研究
了抽样群体大小和测定日密度对不同遗传力QTL的检测效力的影响,模拟试验采用正交
设计安排因素组合。l模拟试验结果表明:个体数和测定日密度对动态性状QTL的分析和
检测具有几乎相同的作用,而且在相同样本含量条件下两者呈现互补的关系;高遗传力
的要比低遗传力的QTL在检测时需要较少的群体和测定日抽样,但不论QTL的遗传力
多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日密度都可以保证足够高的检测效力。),t
/同时,在假设误差方差为齐次的情况下,引用回归析法对动态性状进行定位,分析以
代替似然法。模拟试验结果表明:虽然回归法在各个因素组合条件下对误差方差的估计
准确度和精确度都低于似然法,但两种方法对QTL的检测效力差别不大,而且与似然方
法相比,回归法表现出明显的计算过程简单、计算速度快等优势。b
在QTL定位模型中,嵌入基因效应随过程变化的函数,同以往的单独定位分析和多
性状定位分析相比,不仅考虑了动态性状的动态变化规律,而且减少了待估参数,提高
了QTL的检测效力和定位的准确度。尤其是用Legendre多项式描述动态性状OTL各种
基因效应的作用,既可以发挥多项式在计算上的优势,也确保定位分析模型两端具有相
同的几何形状或拟合参数之间的等价性。
f鉴于动态性状的广泛性及经济重要性,研究该类性状基因定位分析方法对深入揭示
其遗传规律、提高其改良效率具有重要的理论和现实意义J。
关键词动态性状基因定位;Legendre多项式;最大似然法;回归分析:计算机模拟
V
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inTheoreticalFramework
Construction
Preliminary
of for Trait
Dynamic
QTLMapping
ABSTRACT
are value withtimeandother factors
trait those changes quantifiable
Dynamic phenotypic
as level eviommentsetc..Inestimationof
such and
status,performace
age,parities,physical
for a
valuethe with wasdescribed
breeding dynamictrait,theprocessdynamicchanges by
on certainorder.Onthis effectof
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