全球历年人甲型流感病毒H3A1抗原的分子进化研究.pdfVIP

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843 主望垂堑煎芏塞查!!!!至!!旦差堑鲞蔓!!塑曼!t!』垦£i!!坐!盟!盟竺塑!!!!!!堕:!!l踅!盥!!1 ·流感预防与监测· 全球历年人甲型流感病毒H3A1抗原的 分子进化研究 张文彤姜庆五 【摘要】 目的应用生物信息学数据库和工具,对现有的H3N2亚型人甲型流感病毒全球分离 Genbank和流感病毒数据库中全部 株的H3A1抗原序列进化规律进行分析研究。方法下载NcBI 的甲型流感病毒H3Al序列,首先用两步聚类法进行样本拆分,随后分类绘制出完整的进化树。结果 人H3A1序列呈现出单一主干的进化趋势,随着时间的推移,进化树结构和进化模型相关参数均呈现 出一定的变化规律,关键变异株的出现则无明显的地域分布特征。结论 人流感病毒H3A1抗原的 进化主要是病毒抗原漂移和人类免疫选择相互作用的结果,新变异株的出现并未出现明显的地域倾 向性.中国华南地区不应当被认为是}B亚型新变异株的发源地。 【关键词】甲型流感病毒;血凝素;生物信息学;两步聚类法;进化树 for infIu眦aA H3A1strainofallhuman virus拼玉¨G PhylogeneticanaIysis Wen一加曙, J似NG Qf”g-w“眈加以mPH£o,fk触&n斑打,&^“0,n6f缸f加z£^,h如nmz钾邝奶,, s^Ⅻ聃击200032,Chlna tllr朗tenshumans. InnuellzaAvirusr锄ainsan which 【Abstract】obj∞tive importantpathogell of availablehumanInnuenzaAvirLlsH3A1stmins Withthe latestdevelopedbiolnfomatlcst00k,all help were t0 itsevolutionandvanationrules.MethodsAlldatadH3Al exploreddeepIyunderstanding inNCBIG∞bankand databaSeweredownloadedand lncIustaIXwith sequence Innuen距sequence aligned usedt0 method to two cIustermet}10d thedataand tree step 5plit Bayesia“phylogeneticanalysls applied constrLlct treeforeachcIustersR怖uItsTree indicatedthatH3strains precisely phylogenetic topology evolved a evolutiontnlnkandtree andmodd obvious alongsi“gle pattem parametershowed variety for withtime distnbutionfeatureswerefound variatlon tendency per瑚However,noge

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