鹌鹑VIPR-1的克隆、序列特征和组织表达分析.pdfVIP

中国农业科学 2012,45(3):529-539 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.03.015 鹌鹑VIPR-1 的克隆、序列特征和组织表达分析 1 2 2 2 2 2 周 敏 ，李 莹 ，沈 栩 ，徐海平 ，张成广 ，张细权 1 2 （江西教育学院生物技术研究所，南昌 330029； 华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室，广州 510642 ） 摘要：【目的】对鹌鹑血管活性肠肽1 型受体（vasoacitve intestinal peptide type 1 receptor，VIPR-1） cDNA 全长基因进行克隆及分析，为鹌鹑的分子育种提供基础资料。【方法】通过比较基因组学，采用RT-PCR 和RACE 技术，获得鹌鹑了VIPR-1 cDNA 全长序列；通过生物学软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对；采用实时 定量PCR 方法检测了VIPR-1在8 个组织中的表达。【结果】鹌鹑VIPR-1 的cDNA 全长2 427 bp，包含了1 341 bp 的开放性阅读框，编码446 个氨基酸；序列分析显示，克隆获得的鹌鹑VIPR-1 编码区序列与鸡该编码区序列存在 41 个碱基的差异，造成4 个氨基酸残基的不同；VIPR-1 氨基酸序列与鸡、火鸡、斑胸草雀的氨基酸的一致性分别 为99.1%、92.2%、88%，与其它物种的一致性在60%—78%；各物种VIPR-1 蛋白进化树符合物种进化规律；VIPR-1 理化性质表明该蛋白为一偏碱性蛋白，蛋白二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和β-转角构成；在 N-端存在一个 由22 个氨基酸残基（MKSARLRVLLPLLGCLLSAASS）组成的信号肽，7 个α-螺旋构成的跨膜域和C-端结构域，在跨 膜域有胆固醇结合位点；在所检测的8 个组织中VIPR-1mRNA 均有表达，在小肠中表达量最高。【结论】成功地克 隆了鹌鹑VIPR-1 cDNA 全长序列，该基因在小肠组织的表达高于其它组织，在跨膜域存在胆固醇结合位点。 关键词：鹌鹑; 血管活性肠肽1 型受体基因; 分子特征; 组织表达分析 cDNA Cloning, Sequence Analysis and Tissue Specific Expression of Vasoactive Intestinal Peptide Type 1 Receptor (VIPR- 1) in Quails 1 2 2 2 2 2 ZHOU Min , LI Ying , SHEN Xu , XU Hai-ping , ZHANG Cheng-guang , ZHANG Xi-quan 1 2 ( Department of Biological Technology, Jiangxi Institute of Education, Nanchang 330029; College of Animal Science, South China Agricultural University/ Guangdong Provincial Key Lab of Agro-Animal Genomics and Molecular Breeding, Guangzhou 510642) Abstract: 【Objective 】Vasoactive intestinal peptide type