藏鸡和隐性白羽鸡GH基因的SNP检测及其与生长性状间的关联分析.pdfVIP

中国农业科学 2005,38(11):2327-2332 Scientia Agricultura Sinica 藏鸡和隐性白羽鸡GH基因的SNP检测及其 与生长性状间的关联分析 1 1 2 2 1 1 1 1 1 李长春 ，傅 田 ，强巴央宗 ，唐晓惠 ，朱猛进 ，樊 斌 ，熊统安 ，李 奎 ，刘 榜 1 2 （华中农业大学动物科技学院动物分子生物学与育种实验室，武汉 430070 ； 西藏大学西藏农牧学院牧医系，林芝 860000 ） 摘要：利用改良等位基因特异性 PCR（Modified Allele Specific PCR, M-ASP）结合 PCR-RFLP 以及直接测 序方法对藏鸡和隐性白羽鸡生长激素（Growth Hormone, GH）基因内含子 4 （Intron4）的一个位点进行了 SNP 检测，并进行了该基因与藏鸡生长性状的关联分析。检测结果显示，GH 基因 Intron4 的这个位点同时具有 M-ASP 和 SacI-RFLP 多态。测序结果表明，该位点发生了C→G 的碱基突变，产生了CC、CG 和GG三种基因型。两个等位 基因和三种基因型在两鸡种中的分布基本一致。其中，基因型CC和等位基因C的频率最高。χ2 检验结果表明，基 因型频率或者等位基因频率在两鸡种之间没有显著差异（P ＞0.05），而分别在两鸡种内部却存在显著（P ＜0.05） 或极显著（P ＜0.01）差异。方差分析结果表明，基因型与藏鸡的2周龄体重等12个生长性状有显著（P ＜0.05） 或极显著（P ＜0.01）关联；基因型CC与藏鸡的7周龄体重存在显著关联（P ＜0.05）。这暗示了GH 基因是影响藏 鸡生长的主效基因或者它与主效基因相关，而该位点的碱基突变可以作为筛选藏鸡高的7周龄体重的分子标记。 关键词： 藏鸡和隐性白羽鸡；SNP；M-ASP；GH 基因 Intron4；生长性状；关联分析 SNP Detection in Tibetan Chicken and Recessive Chicken GH Gene and Its Associations with Growth Traits 1 1 2 2 1 1 LI Chang-chun ，FU Tian ，QIANG BA Yang-zong ，TANG Xiao-hui ，ZHU Meng-jin ，FAN Bin ， 1 1 1 XIONG Tong-an ，LI Kui ，LIU Bang 1 （ Laboratory of Molecular Biology and Animal Breeding, School of Animal Science and Veterinary Medicine, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070 ; 2Department of Animal Science, Tibet Agriculture and Animal Husbandry College, Linzhi 860000 ）