大麦SSR标记遗传多样性及其与农艺性状关联分析.pdfVIP

中国农业科学 2013,46(2):233-242 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.02.002 大麦SSR 标记遗传多样性及其与农艺性状关联分析 1,2 1,2 1,2 1,2 1,2 1,2 1,2 赖 勇 ，王鹏喜 ，范贵强 ，司二静 ，王 晋 ，杨 轲 ，孟亚雄 ， 1,3 1,2 1,2 1,2 李葆春 ，马小乐 ，尚勋武 ，王化俊 1 2 （甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室/甘肃省干旱生境作物学重点实验室，兰州730070 ； 甘肃农业大学农学院，兰州 730070 ； 3 甘肃农业大学生命科学技术学院，兰州730070 ） 摘要：【目的】分析大麦亲本材料的遗传多样性，寻找与部分农艺性状相关联的分子标记，为大麦杂交组合 的配置及分子标记辅助育种提供依据。【方法】利用86 个SSR 标记对113 份大麦亲本材料进行多态性扫描，并进 行遗传多样性分析。挑选57 个标记进行群体遗传结构分析，在此基础上采用Tassel 2.1 GLM （general linear model）和MLM （mixed linear model）方法进行标记与农艺性状的关联分析。【结果】86 个标记共检测出200 个 等位变异，变异范围为1—5个；基因频率的变异范围为0.0088—1.0000，Shannon指数变异范围为0.0000—1.2236； 遗传相似系数 （GS）变异范围在0.5504—0.9897，平均值为0.7477。通过群体遗传结构分析将供试材料分为4 个 亚群。以GLM 分析，发现9 个与株高、穗长、芒长、穗粒数和小穗着生密度相关联的标记，各标记对表型变异的 解释率在0.0507—0.2766；以MLM 分析，发现6 个与株高、芒长和小穗着生密度相关的标记，各标记对表型变异 的解释率在0.0238—0.1999。【结论】利用SSR 标记分析了 113 份大麦亲本材料的遗传多样性及群体遗传结构， 并通过2 种关联分析模型，分别寻找到了9 个与株高、穗长、芒长、穗粒数相关联，6 个与株高、芒长和小穗着 生密度相关联的标记，这些标记位于1H、2H、3H、4H 和7H 染色体。 关键词：SSR；遗传多样性；群体遗传结构；关联分析 Genetic Diversity and Association Analysis Using SSR Markers in Barley LAI Yong1,2, WANG Peng-xi1,2, FAN Gui-qiang1,2, SI Er-jing 1,2, WANG Jin1,2, YANG Ke1,2, MENG Ya-xiong1,2, LI Bao-chun1,3, MA Xiao-le1,2, SHANG Xun-wu1,2, WANG Hua-jun 1,2 1 ( Gansu Key Laboratory of Crop Improvement Germplasm Enhancement/Gansu Provincial Key Laboratory of Aridland Crop 2