高粱甲基化连锁群A、B的构建及甲基化位点、甲基化模式的分析.pdfVIP

中国农业科学 2012,45(18):3699-3708 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.18.003 高粱甲基化连锁群A、B的构建及甲基化位点、 甲基化模式的分析 1,2 2 2,3 1 段永红 ，王 铭 ，孙 毅 ，杨武德 1 2 3 （山西农业大学农学院，山西太谷 030801 ； 山西省农业科学院生物技术研究中心，太原 030031 ； 农业部黄土高原作物基因资源与种质创制 重点实验室，太原 030031 ） 摘要：【目的】构建高粱甲基化连锁群A和B，并分析其上的甲基化位点分布及甲基化模式变化。【方法】从 高粱品种强优势组合 B V ×1383-2 杂交组合获得的 F 分离群体（共 150 个体）为材料，以 SSR 标记为锚定标记， 2 4 2 采用 SSR 和 MSAP 标记技术，并用 Mapmaker/Exp（Version 3.0）和 Map/Draw 2.1 软件进行分析。【结果】构建 出高粱甲基化连锁群A-a和A-b及甲基化连锁群B-a和B-b，其中，甲基化连锁群A覆盖高粱基因组93.7 cM，包 含 10 个 SSR 标记、20 个 MSAP 标记，甲基化连锁群 B 覆盖高粱基因组 90.4 cM，包含 4 个 SSR 标记、39 个 MSAP 标记；连锁群A-a上甲基化位点仅来源于 EcoRⅠ/Msp Ⅰ酶切组合，而其它连锁群上甲基化位点来源于EcoRⅠ/Msp Ⅰ和EcoRⅠ/Hpa Ⅱ 2 种酶切组合；甲基化连锁群 A-b 和 B-b 上各存在一个稍密集的甲基化位点区域，而连锁群 B-a上存在一个较密集的甲基化位点区域；基于同一酶切的高粱亲本间有多态性差异，F2 群体存在分离，高粱亲本 与杂交种F1 的甲基化模式有2种类型的变化。【结论】MSAP标记可以检测到大量的甲基化差异片段，结合锚定的 SSR 标记，能够有效地构建植物基因组的甲基化遗传连锁群或遗传连锁图谱；在连锁群上检测到 3 个密集的甲基 化位点区域，分别位于SSR 标记Xtxp 302、Xtxp 96及Xtxp 304附近；在获得的连锁群中，发生去甲基化反应的 甲基化位点数高于甲基化水平提高的位点数。 关键词：高粱；SSR；MSAP；DNA甲基化 Construction of Methylation Linkage Groups A and B in Sorghum with MSAP and SSR Markers and Analysis of Methylation Sites and Patterns 1, 2 2 2, 3 1 DUAN Yong-hong , WANG Ming , SUN Yi , YANG Wu-de 1 2 ( C