利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性.pdfVIP

中国农业科学 2012,45(3):405-413 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.03.001 利用SSR 标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性 张立娜，曹桂兰，韩龙植 （中国农业科学院作物科学研究所/ 国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室，北京 100081） 摘要：【目的】通过中国粳稻地方品种的遗传多样性分析，阐明各省份粳稻地方品种的遗传结构及其亲缘关 系，为中国粳稻杂交育种的亲本选配提供科学依据。【方法】利用 43 对 SSR 多态性标记，对原产于中国 17 个省（市、 自治区）的187 份粳稻地方品种进行等位基因多样性、遗传结构和聚类分析。【结果】共检测到等位基因 351 个， 每个位点等位基因变幅为 2—21，平均每个位点等位基因数为 8.2；基因多样性指数变异范围为 0.117—0.908， 平均为 0.550；多态信息含量（PIC）变异范围为 0.114—0.902，平均为 0.523。在 RM72、RM241、RM219、RM412 和 RM232 等位点所检测到的遗传多样性参数值较大。西南、华南、华中粳稻地方品种的遗传多样性明显高于华北 和东北地区；云南省粳稻地方品种遗传多样性最丰富，天津和吉林的粳稻地方品种的遗传多样性相对较低。基于 Nei’s 遗传距离的系统聚类把供试材料分为 8 个小类群，南方粳稻地方品种主要聚类于第 ⅰ、ⅱ、ⅲ、ⅳ和 ⅴ等 5 个小类群，北方粳稻地方品种主要聚类于第ⅵ、ⅶ和ⅷ等 3 个小类群。基于模型的群体结构分析，供试材料被分 为 11 个亚群，有 144 份材料被分到相应的 11 个亚群，其余 43 份材料被分到混合亚群。 【结论】南方稻区粳稻地 方品种的遗传多样性明显高于北方稻区，其中西南稻区的粳稻地方品种遗传多样性最为丰富，而云南是粳稻地方 品种遗传多样性最丰富的省份。北方与南方粳稻地方品种间存在较大的遗传差异，粳稻地方品种间亲缘关系与地 域性存在一定的相关性，这种相关性在北方粳稻地方品种中更为突出。RM72、RM241、RM219、RM412 和 RM232 适 合应用于粳稻地方品种的遗传多样性检测。 关键词：粳稻；地方品种；遗传多样性；遗传结构 Analysis of Genetic Diversity of Japonica Rice Landrace in China with Microsatellite Marker ZHANG Li-na, CAO Gui-lan, HAN Long-zhi (Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences/ The National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement/Key Laboratory of Crop Germplasm Resources and Utilization, Ministry of Agriculture, Beijing 100081) Abstract: 【Objective 】The objective of this study is to analyze the genetic diversity, genetic structure and genetic relationship of japonica rice landrace from China, and to provide effective information for hybrid breeding of japonica rice. 【Method 】 The genetic diversity, genetic structure and cluster analysis of 187 japonica rice landraces from 17 provinces