利用水稻C0t-1 DNA和基因组DNA对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组的比较分析.pdfVIP

中国农业科学 2006,39(6):1083-1090 Scientia Agricultura Sinica 利用水稻 C t-1 DNA和基因组DNA对栽培稻、药用野生稻和 0 疣粒野生稻基因组的比较分析 1 2 1 1, 2 蓝伟侦 ，何光存 ，吴士筠 ，覃 瑞 (1 中南民族大学生命科学学院国家民委生物技术重点实验室，武汉 430074 ； 2 武汉大学生命科学学院植物发育生物学教育部重点实验室，武汉 430072) 摘要：【目的】研究中高度重复序列在稻属不同物种基因组进化中的作用。【方法】用栽培稻C t-1 DNA 和基 0 因组 DNA(gDNA)作为探针，分别对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻进行荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交 (CGH)。【结果】 C t-1 DNA覆盖栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组比例(%)和大小(Mb)分别为47.10±0.16， 0 38.61±0.13，44.38±0.13和212.33±1.21，269.42±0.89以及532.56±1.68。栽培稻gDNA在药用野生稻和疣 粒野生稻基因组中的覆盖率约为 91.0%和 93.6%，含量分别约为 634 Mb 和 1123 Mb，各有 365 Mb 和 591 Mb 不属 于源自栽培稻基因组的中高度重复序列，未被栽培稻gDNA所覆盖的部分，分别为64 Mb 和78 Mb左右。此外，以 C t-1 DNA的组成为依据，对这3个种核型进行了同源性聚类。【结论】稻属中度和高度重复序列和功能基因一样， 0 在不同种中也存在着高度同源性和保守性，并在进化过程中得以保存下来。药用野生稻和疣粒野生稻基因组增大 的重要原因之一，可能是基因组中度和高度重复序列加倍的结果，药用野生稻这种序列扩增相对疣粒野生稻要缓 和得多。另外，这两个野生种在长期进化过程中，由于存在加倍、重排和基因选择性丢失等现象，形成了具有自 己种的特异性的基因组成分。 关键词：C0t-1 DNA ；CGH；核型；药用野生稻；疣粒野生稻 Comparative Analysis of Oryza sativa, O. officinalis and O. meyeriana Genome with C0t-1 DNA and Genomic DNA 1 2 1 1,2 LAN Wei-zhen , HE Guang-cun , WU Shi-jun , QIN Rui 1 ( Key Laboratory of State Ethnic Affairs Commission for Biological Technology, College of Life Sciences, South-Central University for Nationalities, Wuhan 430074 ; 2Key Laboratory of Ministry of Education for Plant Developmental Biology, College of Life