中国柑橘黄龙病病原菌两个原噬菌体超变异基因遗传多样性.pdfVIP

中国农业科学 2013,46(18):3784-3792 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.18.006 中国柑橘黄龙病病原菌两个原噬菌体超变异基因遗传多样性 1,2 2 1,2 2 2 谭 锦 ，王雪峰 ，苏华楠 ，李中安 ，周常勇 1 2 （西南大学植物保护学院，重庆 400716 ； 中国农业科学院柑桔研究所，重庆 400712 ） 摘要：【目的】通过原噬菌体区域高度变异的基因位点研究柑橘黄龙病病原菌亚洲种（‘Candidatus Liberibacter asiaticus’）的种群分化，探讨病原菌种群遗传多样性水平和遗传结构。【方法】基于2 种原噬菌 体类型（SC1 和SC2）对应的超变异基因区域设计2 对引物 （Lap-TJ-F/Lap-TJ-R1 和Lap-TJ-F/Lap-TJ-R2），对中 国不同柑橘产区的224 个 ‘Ca. L. asiaticus’株系进行PCR 检测和序列分析。【结果】PCR 扩增的条带类型呈多 态性，具有4 种条带类型（SC1-1、SC1-2、SC2-1 和SC2-2），西南地区以SC1-1 型为主，广东、广西地区以SC2-1 型为主，福建、江西、浙江地区没有明显优势的扩增型。分析SC1-1 和SC1-2 对应序列表明，其差异系由于132 bp 的卫星序列和24 bp 的小卫星序列2 种串联重复序列数不同引起，而SC2-1 和SC2-2 的差异系由原噬菌体内部基 因重排引起。【结论】中国不同地理来源病原菌株系在原噬菌体区域具有较丰富的多态性，对该基因区域研究将有 助于揭示中国‘Ca. L. asiaticus’种群的遗传多样性。 关键词：柑橘黄龙病；原噬菌体；重复序列；遗传多样性 Genetic Diversity of Two Hypervariable Genes from Prophage Regions of ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’ in China 1,2 2 1,2 2 2 TAN Jin , WANG Xue-feng , SU Hua-nan , LI Zhong-an , ZHOU Chang-yong 1 2 ( College of Plant Protection, Southwest University, Chongqing 400716; Citrus Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Chongqing 400712) Abstract: 【Objective 】 Hypervariable genomic loci of prophage region were used to study population differentiation and genetic diversity of ‘Candidatus Liberibacter asiaticus’, the putative casual agent of citrus Huanglongbing (HLB). 【Method 】 Two primer sets (Lap-T