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养殖花鲈皮肤溃病抗性及敏感性群体的rapd分析
养殖花鲈皮肤溃疡病抗性及敏感性群体的RAPD 分析
符号说明
AFLP 扩增片段长度多态性
MAS 标记辅助选择
mtDNA: 线粒体DNA
PCR 聚合酶链反应
PIC 多态信息含量
QTL 数量性状基因座
RAPD 随机扩增多态DNA
RE 限制性内切酶
RFLP 限制性片段长度多态性
SSR 简单重复序列
VNTR 可变数目串联重复序列
3
养殖花鲈皮肤溃疡病抗性及敏感性群体的RAPD 分析
中文摘要
鲈鱼 Lateolabrax japonicus 是海水网箱养殖鱼类的主要品种之一 但
随着集约化养殖的发展 鲈鱼病害逐年增多 特别是近几年来发生的一种由哈
氏细菌 Vibrio harveyi 引起的传染性皮肤溃疡病 因其流行范围广 危害严
重 给花鲈养殖业造成了巨大的经济损失 本文通过RAPD Random Amplified
Polymorphic DNA 技术 探讨了象山港养殖花鲈群体的基因组DNA 多态性
同时比较了皮肤溃疡病抗性群体 简称为抗性群体 和皮肤溃疡病敏感群体 简
称为敏感群体 两个群体的遗传变异度 对象山港养殖花鲈群体的自身抗性能
力做初步的研究
总结出花鲈基因组DNA 的快速提取方法 在65 水中消化2h 左右 再
加RNA 酶37 消化30min 经酚 氯仿 异戊醇抽提 无水乙醇沉淀 最后
溶于TE 所提的DNA A260/A280 在1.75-1.90 之间
象山港养殖花鲈的 RAPD-PCR 扩增的适宜条件 25ul 反应体系中 模板
2+
DNA 50ng 引物50ng dNTPs 0.1mmol 10×Buffer 2.5ul Mg 2.0mmol
Taq+DNA 聚合酶1.0U 扩增体系参数 94 预变性5min 94 变性1min 38
退火1min 72 延伸2.5min 35 个循环 72 延伸10min
使用 100 条随机引物对47 尾象山港养殖花鲈进行了RAPD 扩增 其中有
25 条引物扩增出具有多态性条带 25 条引物共检测出 165 个位点 其中多态
位点为80 个 多态比率达48.48% 平均每条引物扩增出6.6 个位点 象山港
养殖花鲈群体的遗传相似度为0.8815 遗传变异度为0.1185 Shannon 多样性
指数为 19.5992 多样值为 0.1160 这说明目前象山港养殖花鲈的遗传多样性
比较高
使用了经筛选具有多态性的 25 条随机引物检测了象山港养殖花鲈抗皮肤
溃疡病群体和患皮肤溃疡病群体的基因组DNA 多态性 实验结果发现 抗性
群体的多态位点比率为44.24% 遗传相似度为0.8763 遗传变异度为0.1237
Shannon 多样性指数为19.4248 多样值为0.1149 而敏感群体相应指数分别为
40.37% 0.8831 0.1169 18.7905 和 0.1119 t 检验显示两个群体的遗传多样
性无显著性差异
关键词 花鲈 皮肤溃疡病 遗传多样性 RAPD
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