基于EST-SSR标记的云南野生茶树遗传多样性分析.pdfVIP

— ２２— 江苏农业科学　２０１３年第４１卷第１２期 周　萌，李友勇，孙雪梅，等．基于ＥＳＴ－ＳＳＲ标记的云南野生茶树遗传多样性分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０１３，４１（１２）：２２－２７． 基于ＥＳＴ－ＳＳＲ标记的云南野生茶树遗传多样性分析 １ １ １ １ １ ２ １ １ 周　萌 ，李友勇 ，孙雪梅 ，王家金 ，谢　瑾 ，成　浩 ，汪云刚 ，刘本英 （１．云南省农业科学院茶叶研究所／云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心，云南勐海６６６２０１： ２．中国农业科学院茶叶研究所，浙江杭州３１０００８） 　　摘要：通过使用２７对ＥＳＴ－ＳＳＲ引物对１００份野生茶树资源和２２份栽培品种进行了遗传多样性和亲缘关系的分 析。结果表明：２７对引物共检测到多态性带８８条，有效等位基因变异所占比重为６９．０１％；基因型１８３个，基因型变 幅在４～１１之间，平均６．７８个；Ｓｈａｎｎｏｎ指数在０．３２～１．３５之间，平均０．８８；期望杂合度（０．５２）与观测杂合度（０５２） 一致；多态杂合率平均为０．４８，接近０．５０；Ｎｅｉ氏指数平均为０．５１，高于０．５０；多态信息量ＰＩＣ值平均为０．５２，高于 ０５０，说明云南野生茶树的遗传多样性丰富。１２２份材料聚类为１４个组。亲缘关系树状图在分子水平上显示了我国 云南野生茶树种质资源的亲缘关系，为今后种质资源的保存、开发和研究提供了一定的依据。 　　关键词：茶树；ＥＳＴ－ＳＳＲ；遗传多样性；亲缘关系 　　中图分类号：Ｓ５７１．１０３　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１３）１２－００２２－０６ 　　茶树是中国重要的经济作物之一，也是云南的重要经济 业科学院茶叶研究所的国家种质大叶茶树资源圃（勐海）。 作物。野生茶树为处于自然生长状态下的茶树资源，树龄一 １．２　ＤＮＡ的提取 般在百年至数百年。野生茶树资源不仅是云南茶树原产地的 ［４］ 采用改良的ＣＴＡＢ法提取供试材料的基因组 ＤＮＡ 。 活化石和见证、国家珍贵财富、人类重要的自然遗产，也是研 用０．８％琼脂糖凝胶电泳检测 ＤＮＡ的质量，用 ＮａｎｏＤｒｏｐ ［１］ 究茶树起源、演化和品种创新的重要材料 。在云南众多野 ＮＤ－１０００分光光度计检测 ＤＮＡ的浓度和纯度。根据 ＤＮＡ 生茶树资源中，不乏有优质或性状特异的资源，无疑是品种选 浓度将每份样品用 ｄｄＨＯ稀释到２０～５０ｎｇ／Ｌ，４℃保存 ２ μ 育的最佳材料，可用于资源创新。另一方面，随着科学技术的 备用。 不断进步，一些野生茶树在茶树的分类、演化、育种等方面均具 １．３　ＳＳＲ引物 ［２］ ［５］ 有较高的学术价值 。ＥＳＴ－ＳＳＲ是基于ＥＳＴ序列或ｃＤＮＡ数 在姜燕华 使用的引物中选用多态性高、条带清晰的２７ 据开发的异种分子标记。他来自于功能基因，除具备ＳＳＲ标 对引物，由上海生工生物工程有限公司合成，编号为：Ａ１８、 记的优点外，从ＥＳＴ数据库中获得ＳＳＲ建立ＥＳＴ－ＳＳＲ标记经 Ａ３５、Ａ４１、Ａ４４、Ａ４７、Ａ５３、Ａ５４、Ａ５５、Ａ５８、Ａ１０７、Ａ１１３、Ａ１１４、 济、且通用性高，还具有引物开发成本低、可直接反映骨干功能 Ａ１２０、Ａ１３０、Ａ１３３、Ａ１３４、Ａ１３８、Ａ１４２、Ａ１５６、Ａ１５７、Ａ１５９、 ［１２］ 基因的多样性等特点 。由于该技术具有简便、快速、稳定性