狗枣猕猴桃钙调节蛋白基因生物信息学分析.pdfVIP

甘肃农业科技 2015年 第 2期 GnnsuAgr．Sci．andTechn． No．2 2015 狗枣猕猴桃钙调节蛋白基因生物信息学分析 李然红 ，一，董世鹏 ，陈 鑫 ，安文和 [1．植物生物学黑龙江省高校重点实验室 (哈尔滨师范大学)，黑龙江 哈尔滨 150025；2．牡丹江师范 学院生命科学与技术学院，黑龙江 牡丹江 157012] 摘要 ：通过NCBI查找到狗枣猕猴桃钙调节蛋白基因序列，利用生物信息学方法对该基因编码蛋白的理化性 质、二维结构、三维结构、糖基化位点、所属蛋白家族、代谢途径、进化地位等信息进行了预测。结果表明，该蛋 白富含天冬氨酸和谷氨酸，不含N一糖基化位点和0一糖基化位点，属于EF—hand蛋白家族，在钙信号、cAMP信号转 导及植物与病原茵的相互作用、细胞减数分裂等过程中均有重要作用。 关键词 ：狗枣猕猴桃；钙调节蛋白；生物信息学；蛋白家族；代谢途径 中图分类号：$663．4；Q51 文献标识码：A 文章编号：1001—1463(2015)02—0oo1—04 i：10．3969／i．issn．1001—1463．2015．02．001 BioinformaticsAnalysisofCalmodulingeneinActinidiakolomikta LIRan—hong ．一，DONGShi—peng ，CHENXin ，ANW en—he (1．KeyLaboratoryofPlantBiology，CollegeofHeilongjiangProvince，HarbinNormalUniversity，Hrabin Heilongjiang150025， China；2．CollegeofLifeSciencesandTechnology，MudanjinagNormalUniversity，MudnajiangHeilongjinag157012，China) Abstract： TheCalmodulingeneofActinidiakolom tawasfoundthroughGenebankofNCBI。Andthephysicalnad chemicM properties，two—dimensionalstructure，htree-dimensionalstructure，glycosylationsites，proteinfamily，metabolicpathways nadotherinformationsoftheCalmodulininActinidiakolomiktawerepredictedbybioinformatiCSmehtods．1’Ileresultsshowedtllat血e proteinisrich in glutamicacidna dasparticacid，doesnotcontain N-glycosylationsitesandO—glycosylationsites，belongstohte EF— handproteinfamily．whichplaysna importantroleinhtecalcium signaland cAMP signaltrnasduction，meiosisnadpathogen interaction． K words：Actinidiakolomikta；Calmodulin；Bioinfomr atiCS；Proteinfma ily；Metabolicpathways 狗枣猕猴桃 (Actinidiakolornikta)，别名狗枣 点、所属蛋白家族、代谢途径等信息进行了预测， 子，属猕猴桃科猕猴桃属藤本植物 ，是最为耐寒 以期为其生物学特性的研究及应用奠定理论基础。 的猕猴桃种类之一… ，其果实酸甜可 口、柔软多 1 材料与方法 汁，富含多种氨基酸、维生素和矿物质[2]，具有 通过 NCBI在线搜索，查找到狗枣猕猴桃钙调 强壮、解热及收敛、调节人体血液中pH、使血液 节蛋 白基因及其编码序Y1](GenBank：EF441489．1)， 保持鲜红，增加其输送氧气、营养物质等多种