玉米全基因组中NAC基因家族的鉴定与分析.pdfVIP

山东 农 业 科 学 2015，47(2)：1～6 ShandongAgriculturalSciences DOI：10．14083／j．issn．1001—4942．2015．02．001 玉米全基因组中NAC基因家族的鉴定与分析 葛姗姗 ，唐桂英 ，毕玉平 ，柳展基 (1．山东师范大学，山东 济南 250014；2．山东省农业科学院生物技术研究中心，山东 济南 250100) 摘 要：本试验利用生物信息学方法预测了玉米 NAC基因家族成员、基因结构、染色体定位和系统进化 关系。结果表明，玉米NAC基因家族包含 128个成员，依据其在染色体上的位置系统命名为ZmNACO01～ ZmNAC128；ZrnNAC分布在 lO条染色体上，且分布不均；ZmNAC基因与拟南芥NAC基 因具有一定相似性，可 分为 13个亚家族；基因结构分析发现绝大多数ZmNAC基因含有 1—3个内含子 ；miRNA靶基因预测发现7个 ZmNAC基因为miRNA164的靶基因。 关键词：玉米 ；NAC基因家族 ；生物信息学 中图分类号：$513．01 文献标识号：A 文章编号：1001—4942(2015)02—0001—06 Genome—W ideIdentificationandAnalysisof NAC GeneFamilyinM aize GeShanshan，TangGuiying，BiYuping，LiuZhanji (1．ShandongNormalUniversity，Jinan250014，China； 2．BiotechnologicalResearchCenter，ShandongAcademy0厂AgriculturalSciences，Jinan250100，China) Abstract TheNACgenefamilyinmaize(ZeamaysL．)wasc0mprehensive1yidentifiedbybioinformat- icsinthisresearch，includinggenemembers，genestructure，chromosomelocationandphylogeneticrelation- ship．Asaresult，128NAC geneswerepredictedandnamedasZmNACO01一ZmNAC128 accordingtotheir chromosomelocation．The128ZmNACunevenlydistributedon10chromosomesofmaize．Phylogeneticanaly— sissuggestedthatZmNACgeneshadcertainsimilaritieswithNAC genesfromArabidopsisandcouldbedivided into13subfamilies．GenesturctureanalysisshowedthatmostZmNACgenescontained1～3 introns．Seven ZmNAC geneswerepredictedasthetargetgenesofmiRNA164． Keywords Maize；NACgenefamily；Bioinformatics NAC是一类植物特有的重要转录因子，其N 在气孔的保卫细胞中特异表达，过量表达SNAC1 端含有高度保守的NAM结构域 (PF02365)，大约 基因的水稻抗旱耐盐能力大幅提高。Liu等_5将 由130个氨基酸组成，负责与DNA或其它蛋 白结 水稻 SNAC1基因在棉花中过量表达 ，发现转基因 合；而 c端序列高度变异，具有转录激活功 棉花在干旱和高盐胁迫下蒸腾速率下降，根系发 能 ’ 。NAC基因的功能涉及植物的生长发育调 育增强，进而抗旱耐盐性提高。Yokotani等 发 控、激素信号转导、响应生物和非生物胁迫等 J。 现水稻 OsNAClll基因